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ミスマッチ/ギャップを許容 ミスマッチのみ許容 ： 塩基まで (検索する配列長の25%まで)
双方向を検索 ＋方向のみ検索 －方向のみ検索

2025-04-03 19:23:10, GGGenome : DDBJ release 134.0 (Mar, 2024)

Summary:

Results:

検索語に色がつきます（ミスマッチ・挿入欠失）。

Capsicum annuum cultivar G1-36576 isolate CaT2T chromosome 10.
CP124722.1:162208390-162208415
CCTTCTCCAACAACATTTGAGTGATTTCCA162208390TAAGCCAATTTAACACAGTCCTGAACAAACTTCGATTTTGTTGTTGCTTTAGTTGA
KS13064C03 KS13 Capsicum annuum cDNA, mRNA sequence.
GD056714.1:495-520
TCAACTAAAGCAACAACAAAATCGAAGTTT495GTTCAGGACTGTGTTAAATTGGCTTATGGAAATCACTCAAATGTTGTTGGAGAAGG
KS24052D08 KS24 Capsicum annuum cDNA, mRNA sequence.
GD122701.1:301-326
TCAACTAAAGCAACAACAAAATCGAAGTTT301GTTCAGGACTGTGTTAAATTGGCTTATGGAAATCACTCAAATGTTGTTGGAGAAGG
TSA: Capsicum annuum MGMT_Contig33584 mRNA sequence.
JW083828.1:646-671
TCAACTAAAGCAACAACAAAATCGAAGTTT646GTTCAGGACTGTGTTAAATTGGCTTATGGAAATCACTCAAATGTTGTTGGAGAAGG
Capsicum annuum Takanotsume DNA, chromosome 10, sequence.
AP026705.1:153972127-153972152
TCAACTAAAGCAACAACAAAATCGAAGTTT153972127GTTCAGGACTGTGTTAAATTGGCTTATGGAAATCACTCAAATGTTGTTGGAGAAGG

Data Export:

下記のフォーマットで最大100000件まで検索結果を取得できます。

Debug Info:

Redirect URI : https://gggenome.dbcls.jp/ja/ddbj/TAAGCCAATTTAACACAGTCCTGAAC
lang : ja | db : ddbj | k : 0 | strand : | nogap : | query_string : TAAGCCAATTTAACACAGTCCTGAAC | format : html | download : | debug : 

0.009 | 0.009 | search_start;
0.167 | 0.158 | search_plus_done; http://172.18.8.135:50400/match?q=TAAGCCAATTTAACACAGTCCTGAAC&k=0&no_gap=0&offset=0&limit=50
0.458 | 0.291 | search_minus_done; http://172.18.8.135:50400/match?q=GTTCAGGACTGTGTTAAATTGGCTTA&k=0&no_gap=0&offset=0&limit=49
0.461 | 0.003 | cgi_end;

GGGenome by @meso_cacase at DBCLS
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