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ミスマッチ/ギャップを許容 ミスマッチのみ許容 ： 塩基まで (検索する配列長の25%まで)
双方向を検索 ＋方向のみ検索 －方向のみ検索

2025-04-03 13:48:16, GGGenome : DDBJ release 134.0 (Mar, 2024)

Summary:

Results:

検索語に色がつきます（ミスマッチ・挿入欠失）。

RCRA365TPB Castor bean cDNA library from roots, 1.8 kb Ricinus communis cDNA clone RCRA365, mRNA sequence.
EG686206.1:297-318
TTTGCGAATAGGATAGGAGAGGCTATACCA297GCAGTTGATGGTGGTGCTATTACACTACTTTGGTACCATGTGCTTCGCCTAG
RCRBF49TP Castor bean cDNA library from roots, 1.8 kb Ricinus communis cDNA clone RCRBF49, mRNA sequence.
EG688353.1:489-510
TTTGCGAATAGGATAGGAGAGGCTATACCA489GCAGTTGATGGTGGTGCTATTACACTACTTTGGTACCATGTGCTTCGCCTAG

Data Export:

下記のフォーマットで最大100000件まで検索結果を取得できます。

Debug Info:

Redirect URI : https://gggenome.dbcls.jp/ja/ddbj/TAATAGCACCACCATCAACTGC
lang : ja | db : ddbj | k : 0 | strand : | nogap : | query_string : TAATAGCACCACCATCAACTGC | format : html | download : | debug : 

0.009 | 0.009 | search_start;
0.153 | 0.144 | search_plus_done; http://172.18.8.135:50400/match?q=TAATAGCACCACCATCAACTGC&k=0&no_gap=0&offset=0&limit=50
0.354 | 0.201 | search_minus_done; http://172.18.8.135:50400/match?q=GCAGTTGATGGTGGTGCTATTA&k=0&no_gap=0&offset=0&limit=50
0.356 | 0.002 | cgi_end;

GGGenome by @meso_cacase at DBCLS
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