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データベース：
 

ミスマッチ/ギャップを許容 ミスマッチのみ許容 ： 塩基まで (検索する配列長の25%まで)
双方向を検索 ＋方向のみ検索 －方向のみ検索

2025-04-03 13:00:37, GGGenome : DDBJ release 134.0 (Mar, 2024)

Summary:

Results:

検索語に色がつきます（ミスマッチ・挿入欠失）。

Dianthus caryophyllus mRNA, clone: CES08D03, 5' end sequence.
FY385198.1:199-218
AAGATTAGCAAGATGGATAGAGCTTCGATA199CTTGGGGACGCTATCGATTATTTGAAGGAGCTCTTGCAGAGAATCAGCGA
Dianthus caryophyllus mRNA, clone: CFES03N01, 5' end sequence.
FY395236.1:809-828
AAGATTAGCAAGATGGATAGAGCTTCGATA809CTTGGGGACGCTATCGATTATTTGAAGGAGCTCTTGCAGAGAATCAGCGA
Dianthus caryophyllus mRNA, clone: CFES15_P15, 5' end sequence.
FY399830.1:790-809
AAGATTAGCAAGATGGATAGAGCTTCGATA790CTTGGGGACGCTATCGATTATTTGAAGGAGCTCTTGCAGAGAATCAGCGA
Dianthus caryophyllus mRNA, clone: CFES17_M14, 5' end sequence.
FY400513.1:787-806
AAGATTAGCAAGATGGATAGAGCTTCGATA787CTTGGGGACGCTATCGATTATTTGAAGGAGCTCTTG
TSA: Dianthus caryophyllus mRNA, contig: CAK09.640.C1.
FX297842.1:198-217
AAGATTAGCAAGATGGATAGAGCTTCGATA198CTTGGGGACGCTATCGATTATTTGAAGGAGCTCTTGCAGAGAATCAGCGA

Data Export:

下記のフォーマットで最大100000件まで検索結果を取得できます。

Debug Info:

Redirect URI : https://gggenome.dbcls.jp/ja/ddbj/TAATCGATAGCGTCCCCAAG
lang : ja | db : ddbj | k : 0 | strand : | nogap : | query_string : TAATCGATAGCGTCCCCAAG | format : html | download : | debug : 

0.008 | 0.008 | search_start;
0.163 | 0.155 | search_plus_done; http://172.18.8.135:50400/match?q=TAATCGATAGCGTCCCCAAG&k=0&no_gap=0&offset=0&limit=50
0.590 | 0.427 | search_minus_done; http://172.18.8.135:50400/match?q=CTTGGGGACGCTATCGATTA&k=0&no_gap=0&offset=0&limit=50
0.594 | 0.003 | cgi_end;

GGGenome by @meso_cacase at DBCLS
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