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ミスマッチ/ギャップを許容 ミスマッチのみ許容 ： 塩基まで (検索する配列長の25%まで)
双方向を検索 ＋方向のみ検索 －方向のみ検索

2025-04-03 12:06:57, GGGenome : DDBJ release 134.0 (Mar, 2024)

Summary:

Results:

検索語に色がつきます（ミスマッチ・挿入欠失）。

Porphyra yezoensis cDNA clone:PS020b07_r, 5' end.
AV437355.1:179-198
CGCGCCGCCGCGGCGGCGTTTGACACGACC179TACACCACCTCCTTTACGCCGCTGACCACTGCCTATAACGCGGCCGTTGC
Mimachlamys varia genome assembly, chromosome: 3.
OX392529.1:24251184-24251203
GTGTAATACAGGTATGTAATCTGTCCTCCG24251184GGCGTAAAGGAGGTGGTGTAATACAGATTTGTAATCTGTCCTCTGGGGGT
Mimachlamys varia genome assembly, chromosome: 3.
OX392529.1:24251454-24251473
GTGTAATACAGGTGTGTAATCTGTCCTCCG24251454GGCGTAAAGGAGGTGGTGTAATACAGGTATTTAATCTGTCCTCCGGGGGT
Mimachlamys varia genome assembly, chromosome: 3.
OX392529.1:24251544-24251563
GTGTAATACAGGTGTGTAATCTGTCCTCCT24251544GGCGTAAAGGAGGTGGTGTAATACAGGTATGTTATTTGTCCTCCTGGGGT
Mimachlamys varia genome assembly, chromosome: 3.
OX392529.1:24251634-24251653
GTGTAATACAGGTGTGTAATCTGTCCTCCG24251634GGCGTAAAGGAGGTGGTGTAATACAGGTATGTTATTTGTCCTCCTGGGGT
Mimachlamys varia genome assembly, chromosome: 3.
OX392529.1:24251859-24251878
GTGTAATACAGATTTGTAATCTGTCCTCCG24251859GGCGTAAAGGAGGTGGTGTAATACAGGTATGTAATCTGTCCTCCGGGGGT

Data Export:

下記のフォーマットで最大100000件まで検索結果を取得できます。

Debug Info:

Redirect URI : https://gggenome.dbcls.jp/ja/ddbj/TACACCACCTCCTTTACGCC
lang : ja | db : ddbj | k : 0 | strand : | nogap : | query_string : TACACCACCTCCTTTACGCC | format : html | download : | debug : 

0.009 | 0.009 | search_start;
0.161 | 0.152 | search_plus_done; http://172.18.8.135:50400/match?q=TACACCACCTCCTTTACGCC&k=0&no_gap=0&offset=0&limit=50
0.240 | 0.080 | search_minus_done; http://172.18.8.135:50400/match?q=GGCGTAAAGGAGGTGGTGTA&k=0&no_gap=0&offset=0&limit=49
0.244 | 0.004 | cgi_end;

GGGenome by @meso_cacase at DBCLS
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