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ミスマッチ/ギャップを許容 ミスマッチのみ許容 ： 塩基まで (検索する配列長の25%まで)
双方向を検索 ＋方向のみ検索 －方向のみ検索

2025-04-06 08:16:25, GGGenome : DDBJ release 134.0 (Mar, 2024)

Summary:

Results:

検索語に色がつきます（ミスマッチ・挿入欠失）。

KS20008C02 KS20 Capsicum annuum cDNA, mRNA sequence.
GD094031.1:27-46
GCACGAGGTGCATTCAATATTTTTCT27TACCAAGTATCCCCCTTCCCTCCTGCCAGCAGAAAAAACAAAAAAAACAT
KS20036B06 KS20 Capsicum annuum cDNA, mRNA sequence.
GD096617.1:27-46
GCACGAGGTGCATTCAATATTTTTCT27TACCAAGTATCCCCCTTCCCTCCTGCCAGCAGAAAAAACAAAAAAAACAT
Capsicum annuum cultivar G1-36576 isolate CaT2T chromosome 3.
CP124729.1:200454535-200454554
GGCAGGTGTCTATGCATTCAATATTTTTCT200454535TACCAAGTATCCCCCTTCCCTCCTGCCAGCAGAAAAAACAAAAAAAACAT
Capsicum annuum Takanotsume DNA, chromosome 3, sequence.
AP026698.1:91702105-91702124
ATGTTTTTTTTGTTTTTTCTGCTGGCAGGA91702105GGGAAGGGGGATACTTGGTAAGAAAAATATTGAATGCATAGACACCTGCC

Data Export:

下記のフォーマットで最大100000件まで検索結果を取得できます。

Debug Info:

Redirect URI : https://gggenome.dbcls.jp/ja/ddbj/TACCAAGTATCCCCCTTCCC
lang : ja | db : ddbj | k : 0 | strand : | nogap : | query_string : TACCAAGTATCCCCCTTCCC | format : html | download : | debug : 

0.009 | 0.009 | search_start;
0.493 | 0.484 | search_plus_done; http://172.18.8.135:50400/match?q=TACCAAGTATCCCCCTTCCC&k=0&no_gap=0&offset=0&limit=50
0.603 | 0.109 | search_minus_done; http://172.18.8.135:50400/match?q=GGGAAGGGGGATACTTGGTA&k=0&no_gap=0&offset=0&limit=47
0.603 | 0.001 | cgi_end;

GGGenome by @meso_cacase at DBCLS
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