GGGenome Help | English

データベース：
 

ミスマッチ/ギャップを許容 ミスマッチのみ許容 ： 塩基まで (検索する配列長の25%まで)
双方向を検索 ＋方向のみ検索 －方向のみ検索

2025-01-10 02:49:28, GGGenome : DDBJ release 134.0 (Mar, 2024)

Summary:

Results:

検索語に色がつきます（ミスマッチ・挿入欠失）。

Prunus dulcis DNA, pseudomolecule Pd06.
AP019302.1:23401969-23401992
CCTACAACCGTTGACAAACAAGTCCTCCAT23401969TACCTTAAACAAATCATTCTCCACCCACTTCCCACTTCCCATCTCTCTCTTTTT
Comarum palustre genome assembly, chromosome: 1.
OX637572.1:36021930-36021953
TACAACCTTTGACATATAACATCCAACAAT36021930TACCTTAAACAAATCATTCTCCACCCCATTTCCCACATTCTCAAAGACTAACAT
Geum urbanum genome assembly, chromosome: 4.
OX327000.1:71143429-71143452
TGTTGGTCTCAATGTGGGAACTGTAAGTGG71143429GTGGAGAATGATTTGTTTAAGGTAATGTGCCAAGCCAAGTTACATGTCAAAGGT

Data Export:

下記のフォーマットで最大100000件まで検索結果を取得できます。

Debug Info:

Redirect URI : https://gggenome.dbcls.jp/ja/ddbj/TACCTTAAACAAATCATTCTCCAC
lang : ja | db : ddbj | k : 0 | strand : | nogap : | query_string : TACCTTAAACAAATCATTCTCCAC | format : html | download : | debug : 

0.008 | 0.008 | search_start;
0.378 | 0.369 | search_plus_done; http://172.18.8.135:50400/match?q=TACCTTAAACAAATCATTCTCCAC&k=0&no_gap=0&offset=0&limit=50
0.490 | 0.112 | search_minus_done; http://172.18.8.135:50400/match?q=GTGGAGAATGATTTGTTTAAGGTA&k=0&no_gap=0&offset=0&limit=48
0.490 | 0.001 | cgi_end;

GGGenome by @meso_cacase at DBCLS
This page is licensed under a Creative Commons Attribution 4.0 International License (CC BY 4.0).