GGGenome Help | English

データベース：
 

ミスマッチ/ギャップを許容 ミスマッチのみ許容 ： 塩基まで (検索する配列長の25%まで)
双方向を検索 ＋方向のみ検索 －方向のみ検索

2025-04-03 12:14:31, GGGenome : DDBJ release 134.0 (Mar, 2024)

Summary:

Results:

検索語に色がつきます（ミスマッチ・挿入欠失）。

Brassica rapa subsp. pekinensis cultivar Inbred line 'Chiifu' clone KBrB006J12, *** SEQUENCING IN PROGRESS ***, 4 ordered pieces.
AC189204.2:124036-124055
ATTATGGCTGTAACAGGTGGCTGAGACTGG124036TACGGAGGAGAAGGAGATAGTGGGCATGATTAGAGGTTGTATCAAAACCG
Brassica napus partial HLS1 gene for putative N-acetyltransferase hookless1, exons 1-3.
AJ251988.1:463-482
ATTATGGCTGTAACAGGTGGCTGAGACTGG463TACGGAGGAGAAGGAGATAGTGGGCATGATTAGAGGTTGTATCAAAACCG
Brassica napus cultivar Xiang5A chromosome 2.
CP123877.1:648596-648615
CGGTTTTGATACAACCTCTAATCATGCCCA648596CTATCTCCTTCTCCTCCGTACCAGTCTCAGCCACCTGTTACAGCCATAAT
Brassica rapa genome, scaffold: A01.
LR031571.1:638783-638802
CGGTTTTGATACAACCTCTAATCATGCCCA638783CTATCTCCTTCTCCTCCGTACCAGTCTCAGCCACCTGTTACAGCCATAAT
Brassica rapa genome assembly, chromosome: A01.
LS974617.2:638572-638591
CGGTTTTGATACAACCTCTAATCATGCCCA638572CTATCTCCTTCTCCTCCGTACCAGTCTCAGCCACCTGTTACAGCCATAAT

Data Export:

下記のフォーマットで最大100000件まで検索結果を取得できます。

Debug Info:

Redirect URI : https://gggenome.dbcls.jp/ja/ddbj/TACGGAGGAGAAGGAGATAG
lang : ja | db : ddbj | k : 0 | strand : | nogap : | query_string : TACGGAGGAGAAGGAGATAG | format : html | download : | debug : 

0.009 | 0.009 | search_start;
0.110 | 0.101 | search_plus_done; http://172.18.8.135:50400/match?q=TACGGAGGAGAAGGAGATAG&k=0&no_gap=0&offset=0&limit=50
0.141 | 0.032 | search_minus_done; http://172.18.8.135:50400/match?q=CTATCTCCTTCTCCTCCGTA&k=0&no_gap=0&offset=0&limit=48
0.143 | 0.002 | cgi_end;

GGGenome by @meso_cacase at DBCLS
This page is licensed under a Creative Commons Attribution 4.0 International License (CC BY 4.0).