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ミスマッチ/ギャップを許容 ミスマッチのみ許容 : 塩基まで (検索する配列長の25%まで)
双方向を検索 +方向のみ検索 -方向のみ検索

2025-04-03 15:25:57, GGGenome : DDBJ release 134.0 (Mar, 2024)

Summary:

Results:

検索語に色がつきます(ミスマッチ挿入欠失

Cucumis melo isolate PI 511890 chromosome 4.
CP136104.1:9829356-9829375
TGCTGCCCGGGTCAATGCTTGCGAGATCGG9829356TACTCCTCGGCGTCTAACCAATACACGACCTTAAGATTTATGCTCGAACA
Cucumis melo genomic chromosome, chr_4.
LN713258.1:10044837-10044856
TGCTGCCCGGGTCAATGCTTGCGAGATCGG10044837TACTCCTCGGCGTCTAACCAATACACGACCTTAAGATTTATGCTCGAACA
Citrullus lanatus kinesin-like protein KIN14A (KIN14A) mRNA, complete cds.
MW958204.1:2282-2301
TGCTGCCCGGGTTAATGCTTGTGAGATTGG2282TACTCCTCGGCGTCTAACCAATACACGACCTTAAGATTTATGCTCAAACA
Cucumis melo genomic scaffold, anchoredscaffold00032.
LN681826.1:1511501-1511520
TGTTCGAGCATAAATCTTAAGGTCGTGTAT1511501TGGTTAGACGCCGAGGAGTACCGATCTCGCAAGCATTGACCCGGGCAGCA

Data Export:

下記のフォーマットで最大100000件まで検索結果を取得できます。

Debug Info:

Redirect URI : https://gggenome.dbcls.jp/ja/ddbj/TACTCCTCGGCGTCTAACCA
lang : ja | db : ddbj | k : 0 | strand : | nogap : | query_string : TACTCCTCGGCGTCTAACCA | format : html | download : | debug :

0.009 | 0.009 | search_start;
0.184 | 0.175 | search_plus_done; http://172.18.8.135:50400/match?q=TACTCCTCGGCGTCTAACCA&k=0&no_gap=0&offset=0&limit=50
0.273 | 0.089 | search_minus_done; http://172.18.8.135:50400/match?q=TGGTTAGACGCCGAGGAGTA&k=0&no_gap=0&offset=0&limit=47
0.274 | 0.001 | cgi_end;

GGGenome by @meso_cacase at DBCLS
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