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ミスマッチ/ギャップを許容 ミスマッチのみ許容 ： 塩基まで (検索する配列長の25%まで)
双方向を検索 ＋方向のみ検索 －方向のみ検索

2025-04-03 11:52:45, GGGenome : DDBJ release 134.0 (Mar, 2024)

Summary:

Results:

検索語に色がつきます（ミスマッチ・挿入欠失）。

TSA: Brassica rapa x Raphanus sativus RNA, contig: BB3_8735.
FX738166.1:1342-1361
CAAATGGTCAAGTCCTTTGAAGACACCAAC1342TAGGAGATTCAGCGAGTGATTAGAACAAGGAGATGGAAGAGAGATCAAAA
Brassica napus cultivar Xiang5A chromosome 4.
CP123879.1:12136083-12136102
AATAAAGAAAGTACCTTTGAAGACACCAAC12136083TAGGAGATTCAGCGAGTGATTAGAACAAGGAGATGGAAGAGAGATCAAAA
TSA: Brassica rapa subsp. pekinensis RNA, contig: CF3_14670.
FX702239.1:194-213
TTTTGATCTCTCTTCCATCTCCTTGTTCTA194ATCACTCGCTGAATCTCCTAGTTGGTGTCTTCAAAGGACTTGACCATTTG

Data Export:

下記のフォーマットで最大100000件まで検索結果を取得できます。

Debug Info:

Redirect URI : https://gggenome.dbcls.jp/ja/ddbj/TAGGAGATTCAGCGAGTGAT
lang : ja | db : ddbj | k : 0 | strand : | nogap : | query_string : TAGGAGATTCAGCGAGTGAT | format : html | download : | debug : 

0.009 | 0.009 | search_start;
0.165 | 0.157 | search_plus_done; http://172.18.8.135:50400/match?q=TAGGAGATTCAGCGAGTGAT&k=0&no_gap=0&offset=0&limit=50
0.249 | 0.084 | search_minus_done; http://172.18.8.135:50400/match?q=ATCACTCGCTGAATCTCCTA&k=0&no_gap=0&offset=0&limit=48
0.250 | 0.001 | cgi_end;

GGGenome by @meso_cacase at DBCLS
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