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ミスマッチ/ギャップを許容 ミスマッチのみ許容 ： 塩基まで (検索する配列長の25%まで)
双方向を検索 ＋方向のみ検索 －方向のみ検索

2025-04-15 17:46:31, GGGenome : DDBJ release 134.0 (Mar, 2024)

Summary:

Results:

検索語に色がつきます（ミスマッチ・挿入欠失）。

Helicobacter sp. NHP19-012 DNA, complete genome.
AP024819.1:128500-128519
GAGTTTGTATTGAAATTGGCGGATTTGCAA128500TAGTGGCACAGAGCAACACCCTTTCAAAACTCTTTGGCAAGTTTTCTAGG
UDP96-019 AC- and AG-enriched peach leaf genomic libraries Prunus persica STS genomic clone peach-ac 14, sequence tagged site.
BV079696.1:210-229
CTACTTTTGTTCTGTGTGCCACTGTAACAG210GGTGTTGCTCTGTGCCACTAGGATAAGGGAA
Helicobacter sp. NHP19-003 DNA, complete genome.
AP024814.1:234412-234431
CCTTGCGAACTTGCCAAAGAGTTTTGAGAG234412GGTGTTGCTCTGTGCCACTATTGCAAATCCGCTAATTTTAAGACAAACTC

Data Export:

下記のフォーマットで最大100000件まで検索結果を取得できます。

Debug Info:

Redirect URI : https://gggenome.dbcls.jp/ja/ddbj/TAGTGGCACAGAGCAACACC
lang : ja | db : ddbj | k : 0 | strand : | nogap : | query_string : TAGTGGCACAGAGCAACACC | format : html | download : | debug : 

0.009 | 0.009 | search_start;
0.364 | 0.355 | search_plus_done; http://172.18.8.135:50400/match?q=TAGTGGCACAGAGCAACACC&k=0&no_gap=0&offset=0&limit=50
0.454 | 0.091 | search_minus_done; http://172.18.8.135:50400/match?q=GGTGTTGCTCTGTGCCACTA&k=0&no_gap=0&offset=0&limit=49
0.456 | 0.002 | cgi_end;

GGGenome by @meso_cacase at DBCLS
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