GGGenome Help | English

データベース：
 

ミスマッチ/ギャップを許容 ミスマッチのみ許容 ： 塩基まで (検索する配列長の25%まで)
双方向を検索 ＋方向のみ検索 －方向のみ検索

2025-04-13 05:17:13, GGGenome : DDBJ release 134.0 (Mar, 2024)

Summary:

Results:

検索語に色がつきます（ミスマッチ・挿入欠失）。

Lotus japonicus cDNA, clone: LjFL1-054-AB06, 5' end, protoplasts prepared from suspension-cultured cells.
BW613691.1:13-32
CTGGTCTACTGG13TATAACCGATGCTCACACACACCTCTATTTCTTCGCCTTCGCATCTCATC
Lotus japonicus cDNA, clone: LjFL1-074-CE05, 5' end, protoplasts prepared from suspension-cultured cells.
BW618613.1:2-21
A2TATAACCGATGCTCACACACACCTCTATTTCTTCGCCTTCGCATCTCATC
Lotus japonicus genomic DNA, chromosome 6, clone: LjT05E07, TM0055.
AP004526.1:53364-53383
TTAAAACTGCTATCTCTGAAATGGTCTGAG53364TATAACCGATGCTCACACACACCTCTATTTCTTCGCCTTCGCATCTCATC
Lotus japonicus B-129 DNA, chromosome 6, complete sequence.
AP022634.1:66120330-66120349
TTAAAACTGCTATCTCTGAAATGGTCTGAG66120330TATAACCGATGCTCACACACACCTCTATTTCTTCGCCTTCGCATCTCATC
4_Tbi_b3v08.
OD566982.1:32993-33012
CGCTCCCTTTCGTTGTCAAACTATTCCAAT32993TATAACCGATGCTCACACACACGTTTCTTCTCTCACTTCATTATTATGTG

Data Export:

下記のフォーマットで最大100000件まで検索結果を取得できます。

Debug Info:

Redirect URI : https://gggenome.dbcls.jp/ja/ddbj/TATAACCGATGCTCACACAC
lang : ja | db : ddbj | k : 0 | strand : | nogap : | query_string : TATAACCGATGCTCACACAC | format : html | download : | debug : 

0.009 | 0.009 | search_start;
0.405 | 0.396 | search_plus_done; http://172.18.8.135:50400/match?q=TATAACCGATGCTCACACAC&k=0&no_gap=0&offset=0&limit=50
0.518 | 0.113 | search_minus_done; http://172.18.8.135:50400/match?q=GTGTGTGAGCATCGGTTATA&k=0&no_gap=0&offset=0&limit=45
0.518 | 0.000 | cgi_end;

GGGenome by @meso_cacase at DBCLS
This page is licensed under a Creative Commons Attribution 4.0 International License (CC BY 4.0).