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データベース:

ミスマッチ/ギャップを許容 ミスマッチのみ許容 : 塩基まで (検索する配列長の25%まで)
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2026-03-05 09:43:37, GGGenome : DDBJ release 139.0 (Sep, 2025)

Summary:

Results:

検索語に色がつきます(ミスマッチ挿入欠失

Brassica napus cultivar Xiang5A chromosome 8.
CP151903.1:20267700-20267724
GAATCTTAACGATAGTATTGATCAAAACCT20267700TATCGGTACTGATTCGCTCTTCAACTACGCCGGGAGGTTACCTTCTCTCTCTCTC
Brassica napus genome assembly, chromosome: A08.
HG994362.1:16566911-16566935
GAATCTTAACGATAGTATTGATCAAAACCT16566911TATCGGTACTGATTCGCTCTTCAACTACGCCGGGAGGTTAACTTCTCTCTCTCTC
Brassica napus cultivar Xiang5A chromosome 7.
CP123882.1:9878816-9878840
GAGAGAGAGAGAAGGTAACCTCCCGGCGTA9878816GTTGAAGAGCGAATCAGTACCGATAAGGTTTTGATCAATACTATCGTTAAGATTC

Data Export:

下記のフォーマットで最大100000件まで検索結果を取得できます。

Debug Info:

Redirect URI : https://gggenome.dbcls.jp/ja/ddbj/TATCGGTACTGATTCGCTCTTCAAC
lang : ja | db : ddbj | k : 0 | strand : | nogap : | query_string : TATCGGTACTGATTCGCTCTTCAAC | format : html | download : | debug :

0.009 | 0.009 | search_start;
0.325 | 0.316 | search_plus_done; http://172.18.8.135:50900/match?q=TATCGGTACTGATTCGCTCTTCAAC&k=0&no_gap=0&offset=0&limit=50
0.582 | 0.256 | search_minus_done; http://172.18.8.135:50900/match?q=GTTGAAGAGCGAATCAGTACCGATA&k=0&no_gap=0&offset=0&limit=48
0.582 | 0.001 | cgi_end;

GGGenome by @meso_cacase at DBCLS
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