GGGenome Help | English

データベース:

ミスマッチ/ギャップを許容 ミスマッチのみ許容 : 塩基まで (検索する配列長の25%まで)
双方向を検索 +方向のみ検索 -方向のみ検索

2025-04-08 20:24:48, GGGenome : DDBJ release 134.0 (Mar, 2024)

Summary:

Results:

検索語に色がつきます(ミスマッチ挿入欠失

Lotus japonicus genomic DNA, chromosome 2, clone: LjT13I21, TM0076a.
AP004918.1:64947-64968
GTTTCTGTTTGGTTGACATAAAACGTGTTG64947TCAAATGTGATGAGTGACATACATTTATATAGATACGGGAGGTGCATGAATC
Lotus japonicus genomic DNA, chromosome 2, clone: LjT42N20, TM0665.
AP007500.2:73550-73571
GATTCATGCACCTCCCGTATCTATATAAAT73550GTATGTCACTCATCACATTTGACAACACGTTTTATGTCAACCAAACAGAAAC
Lotus japonicus B-129 DNA, chromosome 2, complete sequence.
AP022630.1:79897910-79897931
GATTCATGCACCTCCCGTATCTATATAAAT79897910GTATGTCACTCATCACATTTGACAACACGTTTTATGTCAACCAAACAGAAAC

Data Export:

下記のフォーマットで最大100000件まで検索結果を取得できます。

Debug Info:

Redirect URI : https://gggenome.dbcls.jp/ja/ddbj/TCAAATGTGATGAGTGACATAC
lang : ja | db : ddbj | k : 0 | strand : | nogap : | query_string : TCAAATGTGATGAGTGACATAC | format : html | download : | debug :

0.008 | 0.008 | search_start;
0.348 | 0.339 | search_plus_done; http://172.18.8.135:50400/match?q=TCAAATGTGATGAGTGACATAC&k=0&no_gap=0&offset=0&limit=50
0.435 | 0.087 | search_minus_done; http://172.18.8.135:50400/match?q=GTATGTCACTCATCACATTTGA&k=0&no_gap=0&offset=0&limit=49
0.437 | 0.001 | cgi_end;

GGGenome by @meso_cacase at DBCLS
This page is licensed under a Creative Commons Attribution 4.0 International License (CC BY 4.0).