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ミスマッチ/ギャップを許容 ミスマッチのみ許容 ： 塩基まで (検索する配列長の25%まで)
双方向を検索 ＋方向のみ検索 －方向のみ検索

2025-04-03 12:07:45, GGGenome : DDBJ release 134.0 (Mar, 2024)

Summary:

Results:

検索語に色がつきます（ミスマッチ・挿入欠失）。

KR 1020160012808-A/9: Nucleic acid molecules and primer sets related to restoration of male sterility in pepper and uses thereof.
LG142596.1:70009-70037
TTTTGACTCAAATTAAGCTGCAGGCTCCAC70009TCAAGGAAATCCCCAAATAAGTGTGAACCTATGCATGTCTACCATTGGTATTGGTACTG
Capsicum annuum cultivar G1-36576 isolate CaT2T chromosome 6.
CP124726.1:246575885-246575913
TTTTGACTCAAATTAAGCTGCAGGCTCCAC246575885TCAAGGAAATCCCCAAATAAGTGTGAACCTATGCATGTCTACCATTGGTATTGGTACTG
Capsicum annuum Takanotsume DNA, chromosome 6, sequence.
AP026701.1:8558608-8558636
CAGTACCAATACCAATGCTAGACATGCATA8558608GGTTCACACTTATTTGGGGATTTCCTTGAGTGGAGCCTGTGGCTTAATTTGATTCAAAA

Data Export:

下記のフォーマットで最大100000件まで検索結果を取得できます。

Debug Info:

Redirect URI : https://gggenome.dbcls.jp/ja/ddbj/TCAAGGAAATCCCCAAATAAGTGTGAACC
lang : ja | db : ddbj | k : 0 | strand : | nogap : | query_string : TCAAGGAAATCCCCAAATAAGTGTGAACC | format : html | download : | debug : 

0.009 | 0.009 | search_start;
0.397 | 0.388 | search_plus_done; http://172.18.8.135:50400/match?q=TCAAGGAAATCCCCAAATAAGTGTGAACC&k=0&no_gap=0&offset=0&limit=50
0.486 | 0.089 | search_minus_done; http://172.18.8.135:50400/match?q=GGTTCACACTTATTTGGGGATTTCCTTGA&k=0&no_gap=0&offset=0&limit=48
0.486 | 0.001 | cgi_end;

GGGenome by @meso_cacase at DBCLS
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