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ミスマッチ/ギャップを許容 ミスマッチのみ許容 : 塩基まで (検索する配列長の25%まで)
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2025-04-12 13:13:18, GGGenome : DDBJ release 134.0 (Mar, 2024)

Summary:

Results:

検索語に色がつきます(ミスマッチ挿入欠失

Arachis hypogaea DNA, clone: AHGS44N05.
DH961584.1:110-129
AAGCAAAGACAAGCTACCTGAAGCTAAGCT110TCACAAGTTCACTTTGGGCAAACACCATATAGAGAGAGAGAGAGAGAGAG
Arachis hypogaea cultivar Shitouqi chromosome A07.
CP030989.1:21544194-21544213
AAGCAAAGACAAGCTACCTGAAGCTAAGCT21544194TCACAAGTTCACTTTGGGCAAACACCATATATATATATATATATATATAT
Sciurus vulgaris genome assembly, chromosome: 9.
LR738619.1:105877878-105877897
GAGAGTAAACCTTGAATTTTATTCAACTTT105877878TGCCCAAAGTGAACTTGTGATAATATTTAACAGCTATAGAACAAAGATCA

Data Export:

下記のフォーマットで最大100000件まで検索結果を取得できます。

Debug Info:

Redirect URI : https://gggenome.dbcls.jp/ja/ddbj/TCACAAGTTCACTTTGGGCA
lang : ja | db : ddbj | k : 0 | strand : | nogap : | query_string : TCACAAGTTCACTTTGGGCA | format : html | download : | debug :

0.009 | 0.009 | search_start;
0.326 | 0.317 | search_plus_done; http://172.18.8.135:50400/match?q=TCACAAGTTCACTTTGGGCA&k=0&no_gap=0&offset=0&limit=50
0.419 | 0.094 | search_minus_done; http://172.18.8.135:50400/match?q=TGCCCAAAGTGAACTTGTGA&k=0&no_gap=0&offset=0&limit=48
0.420 | 0.001 | cgi_end;

GGGenome by @meso_cacase at DBCLS
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