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ミスマッチ/ギャップを許容 ミスマッチのみ許容 ： 塩基まで (検索する配列長の25%まで)
双方向を検索 ＋方向のみ検索 －方向のみ検索

2025-04-03 15:36:50, GGGenome : DDBJ release 134.0 (Mar, 2024)

Summary:

Results:

検索語に色がつきます（ミスマッチ・挿入欠失）。

EG-A11_010_G12 Oil palm abnormal apex Lambda Zap Library Elaeis guineensis cDNA, mRNA sequence.
CN600400.1:6-25
TTTGC6TCAGAGCTCAGACGCAGAGAAAGAGAGAGAGGGATACCACGAGGAAATAA
AGENCOURT_90006979 NIH_ZGC_29 Danio rerio cDNA clone IMAGE:8809644 5', mRNA sequence.
EE691925.1:806-825
CAGCCCTGAGAGGATCAGAGGCGTATGTAT806TCAGAGCTCAGACGCAGAGATCAGGACGAGCGAACAGAGCATGGATGATT
Thalassophryne amazonica genome assembly, chromosome: 10.
LR722975.1:14429312-14429331
GACGTGTTGATATTTCTTGAGCTCCATATT14429312TCTCTGCGTCTGAGCTCTGAACCTTCTCTGTAACACACAAGCTGCCCAGT
Elaeis guineensis EST, clone (6lib)_isotig36943.
LM632586.1:668-687
TTATTTCCTCGTGGTATCCCTCTCTCTCTT668TCTCTGCGTCTGAGCTCTGAGCAAA

Data Export:

下記のフォーマットで最大100000件まで検索結果を取得できます。

Debug Info:

Redirect URI : https://gggenome.dbcls.jp/ja/ddbj/TCAGAGCTCAGACGCAGAGA
lang : ja | db : ddbj | k : 0 | strand : | nogap : | query_string : TCAGAGCTCAGACGCAGAGA | format : html | download : | debug : 

0.009 | 0.009 | search_start;
0.247 | 0.239 | search_plus_done; http://172.18.8.135:50400/match?q=TCAGAGCTCAGACGCAGAGA&k=0&no_gap=0&offset=0&limit=50
0.437 | 0.190 | search_minus_done; http://172.18.8.135:50400/match?q=TCTCTGCGTCTGAGCTCTGA&k=0&no_gap=0&offset=0&limit=48
0.439 | 0.002 | cgi_end;

GGGenome by @meso_cacase at DBCLS
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