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データベース：
 

ミスマッチ/ギャップを許容 ミスマッチのみ許容 ： 塩基まで (検索する配列長の25%まで)
双方向を検索 ＋方向のみ検索 －方向のみ検索

2025-04-03 12:30:25, GGGenome : DDBJ release 134.0 (Mar, 2024)

Summary:

Results:

検索語に色がつきます（ミスマッチ・挿入欠失）。

TSA: Allium cepa CUDHLF2_8838 mRNA sequence.
JR851656.1:153-178
CATCCACTGAAAACTTACATATTTCAAACA153TCAGATTAATATTTTCCAACACTTCCCATTCTATATCCACTTAGTCAGAAAATCAA
TSA: Allium fistulosum mRNA, contig: AFU_08421.
FX562146.1:1070-1095
TTGATTTTCTGACTAAGTGGATATAGAGTG1070GGAAGTGTTGGAAAATATTAATCTGATGTTTGAATTATGTAAGTTTTCAGTGGACG

Data Export:

下記のフォーマットで最大100000件まで検索結果を取得できます。

Debug Info:

Redirect URI : https://gggenome.dbcls.jp/ja/ddbj/TCAGATTAATATTTTCCAACACTTCC
lang : ja | db : ddbj | k : 0 | strand : | nogap : | query_string : TCAGATTAATATTTTCCAACACTTCC | format : html | download : | debug : 

0.009 | 0.009 | search_start;
0.292 | 0.283 | search_plus_done; http://172.18.8.135:50400/match?q=TCAGATTAATATTTTCCAACACTTCC&k=0&no_gap=0&offset=0&limit=50
0.392 | 0.100 | search_minus_done; http://172.18.8.135:50400/match?q=GGAAGTGTTGGAAAATATTAATCTGA&k=0&no_gap=0&offset=0&limit=49
0.393 | 0.001 | cgi_end;

GGGenome by @meso_cacase at DBCLS
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