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ミスマッチ/ギャップを許容 ミスマッチのみ許容 ： 塩基まで (検索する配列長の25%まで)
双方向を検索 ＋方向のみ検索 －方向のみ検索

2025-04-11 23:19:24, GGGenome : DDBJ release 134.0 (Mar, 2024)

Summary:

Results:

検索語に色がつきます（ミスマッチ・挿入欠失）。

Arachis hypogaea EST, cultivar Minhua6, clone GFBZZHF01DIGQQ.
LN675403.1:310-331
ACTATCAATTTACATGTTAAAAGTTTCCAG310TCAGTCTTGATAAGGTGCCAAAAATAGTTATTTCTTCAGCAGACTTAGTTCA
Arachis hypogaea cultivar Shitouqi chromosome A07.
CP030989.1:62523204-62523225
ACTATCAATTTACATGTTAAAAGTTTCCAG62523204TCAGTCTTGATAAGGTGCCAAAAATAGTTATTTCTTCAGCAGACTTAGTTCA
Arachis hypogaea DNA, clone: AHGS43O04.
DH961650.1:485-506
TGAACTAAGTCTGCTGAAGAAATAACTATT485TTTGGCACCTTATCAAGACTGACTGGAAACTTTTAACATGTAAATTGATAGT
Arachis hypogaea cultivar Shitouqi chromosome B07.
CP030999.1:49800688-49800709
TGAACTAAGTCTGCTGAAGAAATAACTATT49800688TTTGGCACCTTATCAAGACTGACTGGAAACTTTTAACATGTAAATTGATAGT
Arachis ipaensis cultivar K30076 chromosome 07.
CP049898.1:51152230-51152251
TGAACTAAGTCTGCTGAAGAAATAACTATT51152230TTTGGCACCTTATCAAGACTGACTGGAAACTTTTAACATGTAAATTGATAGT

Data Export:

下記のフォーマットで最大100000件まで検索結果を取得できます。

Debug Info:

Redirect URI : https://gggenome.dbcls.jp/ja/ddbj/TCAGTCTTGATAAGGTGCCAAA
lang : ja | db : ddbj | k : 0 | strand : | nogap : | query_string : TCAGTCTTGATAAGGTGCCAAA | format : html | download : | debug : 

0.009 | 0.009 | search_start;
0.439 | 0.430 | search_plus_done; http://172.18.8.135:50400/match?q=TCAGTCTTGATAAGGTGCCAAA&k=0&no_gap=0&offset=0&limit=50
0.558 | 0.119 | search_minus_done; http://172.18.8.135:50400/match?q=TTTGGCACCTTATCAAGACTGA&k=0&no_gap=0&offset=0&limit=48
0.560 | 0.002 | cgi_end;

GGGenome by @meso_cacase at DBCLS
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