GGGenome Help | English

データベース：
 

ミスマッチ/ギャップを許容 ミスマッチのみ許容 ： 塩基まで (検索する配列長の25%まで)
双方向を検索 ＋方向のみ検索 －方向のみ検索

2025-04-03 11:27:58, GGGenome : DDBJ release 134.0 (Mar, 2024)

Summary:

Results:

検索語に色がつきます（ミスマッチ・挿入欠失）。

Arachis hypogaea cultivar Shitouqi chromosome B05.
CP030997.1:122903750-122903769
TAGTCAATTATCTTCATTATCTTATAATTT122903750TCATGCCAAACTAAGTCCCATTCAGACTATGAAGTCATGAGTTATAATCA
Arachis ipaensis cultivar K30076 chromosome 05.
CP049896.1:129861809-129861828
TAGTCAATTATCTTCATTATCTTATAATTT129861809TCATGCCAAACTAAGTCCCATTCAGACTATGAAGTCATGAGTTATAATCA
Arachis hypogaea DNA, clone: AHGS43D07.
DH961698.1:374-393
TGATTATAACTCATGACTTTATAGTCTGAA374TGGGACTTAGTTTGGCATGAAAATTATAAGATAATGAAGATAATTGACTA
Arachis hypogaea cultivar Shitouqi chromosome A05.
CP030987.1:106133588-106133607
TGATTATAACTCATGACTTTATAGTCTGAA106133588TGGGACTTAGTTTGGCATGAAAATTATAAGATAATGAAGATAATTGACTA

Data Export:

下記のフォーマットで最大100000件まで検索結果を取得できます。

Debug Info:

Redirect URI : https://gggenome.dbcls.jp/ja/ddbj/TCATGCCAAACTAAGTCCCA
lang : ja | db : ddbj | k : 0 | strand : | nogap : | query_string : TCATGCCAAACTAAGTCCCA | format : html | download : | debug : 

0.008 | 0.008 | search_start;
0.155 | 0.147 | search_plus_done; http://172.18.8.135:50400/match?q=TCATGCCAAACTAAGTCCCA&k=0&no_gap=0&offset=0&limit=50
0.250 | 0.095 | search_minus_done; http://172.18.8.135:50400/match?q=TGGGACTTAGTTTGGCATGA&k=0&no_gap=0&offset=0&limit=48
0.251 | 0.002 | cgi_end;

GGGenome by @meso_cacase at DBCLS
This page is licensed under a Creative Commons Attribution 4.0 International License (CC BY 4.0).