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ミスマッチ/ギャップを許容 ミスマッチのみ許容 ： 塩基まで (検索する配列長の25%まで)
双方向を検索 ＋方向のみ検索 －方向のみ検索

2025-04-03 11:27:01, GGGenome : DDBJ release 134.0 (Mar, 2024)

Summary:

Results:

検索語に色がつきます（ミスマッチ・挿入欠失）。

Brassica napus cultivar Xiang5A chromosome 13.
CP123888.1:48657832-48657851
AACATAAGCAATTTAAATAAAATGTAGAAA48657832TCATGGACACAACATTCGTGAAATAAATATATAAATATTTATATAACAGT
Nephrotoma guestfalica genome assembly, chromosome: 3.
OY829915.1:129996636-129996655
CCATTCTGTGGTAAAATCTCAAACATGCTT129996636TCATGGACACAACATTCGTGATTGTGAGCTCAATTCAAGAAAGAAGATTA
Brassica oleracea var. viridis mRNA, clone: KALE-077I21, 3' end sequence.
DK544794.1:697-716
ACTGTTATATAAATATTTATATATTTATTT697CACGAATGTTGTGTCCATGATTTCTACATTTTATTTAAATTGCTTATGTT
BOGGY42TR BOGG Brassica oleracea genomic clone BOGGY42, genomic survey sequence.
BH487113.1:330-349
ACTGTTATATAAATATTTATATATTTATTT330CACGAATGTTGTGTCCATGATTTCTACATTTTATTTAAATTGCTTATGTT
Brassica oleracea var. viridis AG mRNA, complete cds.
KC984300.2:1001-1020
ACTGTTATATAAATATTTATATATTTATTT1001CACGAATGTTGTGTCCATGATTTCTACATTTTATTTAAATTGCTTATGTT
Brassica oleracea HDEM genome, scaffold: C1.
LR031878.1:7659719-7659738
ACTGTTATATAAATATTTATATATTTATTT7659719CACGAATGTTGTGTCCATGATTTCTACATTTTATTTAAATTGCTTATGTT

Data Export:

下記のフォーマットで最大100000件まで検索結果を取得できます。

Debug Info:

Redirect URI : https://gggenome.dbcls.jp/ja/ddbj/TCATGGACACAACATTCGTG
lang : ja | db : ddbj | k : 0 | strand : | nogap : | query_string : TCATGGACACAACATTCGTG | format : html | download : | debug : 

0.009 | 0.009 | search_start;
0.170 | 0.161 | search_plus_done; http://172.18.8.135:50400/match?q=TCATGGACACAACATTCGTG&k=0&no_gap=0&offset=0&limit=50
0.339 | 0.169 | search_minus_done; http://172.18.8.135:50400/match?q=CACGAATGTTGTGTCCATGA&k=0&no_gap=0&offset=0&limit=48
0.342 | 0.003 | cgi_end;

GGGenome by @meso_cacase at DBCLS
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