GGGenome Help | English

データベース：
 

ミスマッチ/ギャップを許容 ミスマッチのみ許容 ： 塩基まで (検索する配列長の25%まで)
双方向を検索 ＋方向のみ検索 －方向のみ検索

2025-04-03 13:08:34, GGGenome : DDBJ release 134.0 (Mar, 2024)

Summary:

Results:

検索語に色がつきます（ミスマッチ・挿入欠失）。

Lupinus angustifolius cultivar Tanjil voucher WA chromosome LG-11.
CP023123.1:10245278-10245297
GTCCTCATCCTATCCTCATCCCCATCCTCT10245278TCCACATCTGCATCCTATCGTCACCCTCTTCCTCTTCCTTATCCTCATCC
Allium cepa genome assembly, chromosome: 3.
LR994631.1:229601572-229601591
CACCATCCTCTCCCCATCGTCGTCCCTCGC229601572TCCACATCTGCATCCTATCGACCAACTGTCAGCTCCTCCTTCGTATTTCA

Data Export:

下記のフォーマットで最大100000件まで検索結果を取得できます。

Debug Info:

Redirect URI : https://gggenome.dbcls.jp/ja/ddbj/TCCACATCTGCATCCTATCG
lang : ja | db : ddbj | k : 0 | strand : | nogap : | query_string : TCCACATCTGCATCCTATCG | format : html | download : | debug : 

0.009 | 0.009 | search_start;
0.161 | 0.152 | search_plus_done; http://172.18.8.135:50400/match?q=TCCACATCTGCATCCTATCG&k=0&no_gap=0&offset=0&limit=50
0.248 | 0.087 | search_minus_done; http://172.18.8.135:50400/match?q=CGATAGGATGCAGATGTGGA&k=0&no_gap=0&offset=0&limit=48
0.248 | 0.000 | cgi_end;

GGGenome by @meso_cacase at DBCLS
This page is licensed under a Creative Commons Attribution 4.0 International License (CC BY 4.0).