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ミスマッチ/ギャップを許容 ミスマッチのみ許容 : 塩基まで (検索する配列長の25%まで)
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2025-04-08 02:13:39, GGGenome : DDBJ release 134.0 (Mar, 2024)

Summary:

Results:

検索語に色がつきます(ミスマッチ挿入欠失

Lotus japonicus genomic DNA, chromosome 3, clone: LjT11L01, TM1658.
AP007265.1:86416-86435
TGGTGATTGGCCCCAACAGGTTCATCTCAA86416TCCATGGCTCTTATTTATGCCTAATCATGTTACTAATTGTATTTTGTAAC
Lotus japonicus B-129 DNA, chromosome 3, complete sequence.
AP022631.1:71078078-71078097
GTTACAAAATACAATTAGTAACATGATTAG71078078GCATAAATAAGAGCCATGGATTGAGATGAACCTGTTGGGGCCAATCACCA
Lithophane socia genome assembly, chromosome: 3.
OX383254.1:2555546-2555565
TTAGATTCTGTATGAAATTATAGGTACTTT2555546GCATAAATAAGAGCCATGGAAAGTTTGGCATTTTGTTTGCGAATTTTGGA

Data Export:

下記のフォーマットで最大100000件まで検索結果を取得できます。

Debug Info:

Redirect URI : https://gggenome.dbcls.jp/ja/ddbj/TCCATGGCTCTTATTTATGC
lang : ja | db : ddbj | k : 0 | strand : | nogap : | query_string : TCCATGGCTCTTATTTATGC | format : html | download : | debug :

0.009 | 0.009 | search_start;
0.370 | 0.361 | search_plus_done; http://172.18.8.135:50400/match?q=TCCATGGCTCTTATTTATGC&k=0&no_gap=0&offset=0&limit=50
0.453 | 0.083 | search_minus_done; http://172.18.8.135:50400/match?q=GCATAAATAAGAGCCATGGA&k=0&no_gap=0&offset=0&limit=49
0.454 | 0.001 | cgi_end;

GGGenome by @meso_cacase at DBCLS
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