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データベース:

ミスマッチ/ギャップを許容 ミスマッチのみ許容 : 塩基まで (検索する配列長の25%まで)
双方向を検索 +方向のみ検索 -方向のみ検索

2025-04-03 18:31:45, GGGenome : DDBJ release 134.0 (Mar, 2024)

Summary:

Results:

検索語に色がつきます(ミスマッチ挿入欠失

020813KAUA999077HT (KAUA) Actinidia chinensis CK51-05 petal Actinidia chinensis cDNA clone KAUAA99907, mRNA sequence.
FG485185.1:35-54
GATTCATTCAACATCCCTCAATACACACCC35TCCCCGACAGAAGTGAAACGCGAGGTCGAAAAAGAAGGCTCCTTCATCGT
Actinidia deliciosa salicylic acid methyltransferase mRNA, complete cds.
OL661269.1:793-812
GATTCATTCAACATCCCTCAATACACACCC793TCCCCGACAGAAGTGAAACGCGAGGTCGAAAAAGAAGGCTCCTTCATCGT

Data Export:

下記のフォーマットで最大100000件まで検索結果を取得できます。

Debug Info:

Redirect URI : https://gggenome.dbcls.jp/ja/ddbj/TCCCCGACAGAAGTGAAACG
lang : ja | db : ddbj | k : 0 | strand : | nogap : | query_string : TCCCCGACAGAAGTGAAACG | format : html | download : | debug :

0.009 | 0.009 | search_start;
0.224 | 0.215 | search_plus_done; http://172.18.8.135:50400/match?q=TCCCCGACAGAAGTGAAACG&k=0&no_gap=0&offset=0&limit=50
0.308 | 0.084 | search_minus_done; http://172.18.8.135:50400/match?q=CGTTTCACTTCTGTCGGGGA&k=0&no_gap=0&offset=0&limit=48
0.308 | 0.000 | cgi_end;

GGGenome by @meso_cacase at DBCLS
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