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データベース:

ミスマッチ/ギャップを許容 ミスマッチのみ許容 : 塩基まで (検索する配列長の25%まで)
双方向を検索 +方向のみ検索 -方向のみ検索

2026-02-07 11:28:21, GGGenome : DDBJ release 138.0 (Jun, 2025)

Summary:

Results:

検索語に色がつきます(ミスマッチ挿入欠失

Vigna angularis mRNA, clone: VES06H20.
HX944527.1:79-98
ATCTAATTTTTTGCCTTGTTTTGTTCCCAA79TCCCTTGTTTTTCGATCTGGGTCTGAAAGAAACTTCTGTTTTTTTATTGT
Vigna angularis var. angularis DNA, chromosome 3, almost complete sequence, cultivar: Shumari.
AP015036.1:6522080-6522099
ACAATAAAAAAACAGAAGTTTCTTTCAGAC6522080CCAGATCGAAAAACAAGGGATTGGGAACAAAACAAGGCAAAAAATTAGAT
Vigna mungo isolate Urdbean chromosome 11.
CP144690.1:5374991-5375010
CAATAAAAAAAACAGAAGTTTCCTTCAGAC5374991CCAGATCGAAAAACAAGGGATTGGGAACAAAACAAGGCAAAAATTAGATC

Data Export:

下記のフォーマットで最大100000件まで検索結果を取得できます。

Debug Info:

Redirect URI : https://gggenome.dbcls.jp/ja/ddbj/TCCCTTGTTTTTCGATCTGG
lang : ja | db : ddbj | k : 0 | strand : | nogap : | query_string : TCCCTTGTTTTTCGATCTGG | format : html | download : | debug :

0.009 | 0.009 | search_start;
0.349 | 0.340 | search_plus_done; http://172.18.8.135:50800/match?q=TCCCTTGTTTTTCGATCTGG&k=0&no_gap=0&offset=0&limit=50
0.450 | 0.101 | search_minus_done; http://172.18.8.135:50800/match?q=CCAGATCGAAAAACAAGGGA&k=0&no_gap=0&offset=0&limit=49
0.452 | 0.002 | cgi_end;

GGGenome by @meso_cacase at DBCLS
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