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ミスマッチ/ギャップを許容 ミスマッチのみ許容 : 塩基まで (検索する配列長の25%まで)
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2025-04-09 22:28:10, GGGenome : DDBJ release 134.0 (Mar, 2024)

Summary:

Results:

検索語に色がつきます(ミスマッチ挿入欠失

Manihot esculenta mRNA, clone: CAS01_036_J11, 3'end.
DB950271.1:454-474
TCCCTCTTTTATCTCCCATGAGTTCCTTCC454TCCGCCGTAGCCACTTCCATTAATCGGTGATTGTGGTGCTGATGGCCACCC
U_UZ-100602_plate40l16.b1 Full-length enriched cDNA library of cassava MPER417-003 Manihot esculenta subsp. peruviana cDNA, mRNA sequence.
JK000667.1:427-447
GGGTGGCCATCAGCACAACAATCACCGATT427AATGGAAGTGGCTACGGCGGAGGAAGGACACCATGGGAGATAAAAGAGGGA

Data Export:

下記のフォーマットで最大100000件まで検索結果を取得できます。

Debug Info:

Redirect URI : https://gggenome.dbcls.jp/ja/ddbj/TCCGCCGTAGCCACTTCCATT
lang : ja | db : ddbj | k : 0 | strand : | nogap : | query_string : TCCGCCGTAGCCACTTCCATT | format : html | download : | debug :

0.008 | 0.008 | search_start;
0.190 | 0.181 | search_plus_done; http://172.18.8.135:50400/match?q=TCCGCCGTAGCCACTTCCATT&k=0&no_gap=0&offset=0&limit=50
0.382 | 0.192 | search_minus_done; http://172.18.8.135:50400/match?q=AATGGAAGTGGCTACGGCGGA&k=0&no_gap=0&offset=0&limit=49
0.383 | 0.001 | cgi_end;

GGGenome by @meso_cacase at DBCLS
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