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ミスマッチ/ギャップを許容 ミスマッチのみ許容 ： 塩基まで (検索する配列長の25%まで)
双方向を検索 ＋方向のみ検索 －方向のみ検索

2025-04-12 20:24:39, GGGenome : DDBJ release 134.0 (Mar, 2024)

Summary:

Results:

検索語に色がつきます（ミスマッチ・挿入欠失）。

Porphyra yezoensis cDNA, clone:PF031d07_r, 5'end.
AU188865.1:248-267
CCATCCGCTTTCCCCCTCCCCCCTTCCCCA248TCCGCCTCTGTCTCCTATTCTGCCCCCGCCGGCCCTCTATCCGCTTCCTG
Porphyra yezoensis cDNA, clone:PFL044g03_r, 5'end.
AU193392.1:13-32
CCCCCTTCCCCA13TCCGCCTCTGTCTCCTATTCTGCCCCCGCCGGCCCCCTATCCGCTTCCTG
Brenthis daphne genome assembly, chromosome: 3.
OX352473.1:3451789-3451808
TTATAAATTTCGTTGTTGGAATCGGAAACG3451789GAATAGGAGACAGAGGCGGAAGGGAGATGTATTAAGGGCAGGTCTAATAA
Aphodius sticticus genome assembly, chromosome: 3.
OZ014508.1:17546337-17546356
TGGTACGTGTGGGTTTCCATCCAGCAGCGA17546337GAATAGGAGACAGAGGCGGAAAGTATGCCGCGAAAGCCCAAAAGCAACCT

Data Export:

下記のフォーマットで最大100000件まで検索結果を取得できます。

Debug Info:

Redirect URI : https://gggenome.dbcls.jp/ja/ddbj/TCCGCCTCTGTCTCCTATTC
lang : ja | db : ddbj | k : 0 | strand : | nogap : | query_string : TCCGCCTCTGTCTCCTATTC | format : html | download : | debug : 

0.009 | 0.009 | search_start;
0.386 | 0.377 | search_plus_done; http://172.18.8.135:50400/match?q=TCCGCCTCTGTCTCCTATTC&k=0&no_gap=0&offset=0&limit=50
0.504 | 0.118 | search_minus_done; http://172.18.8.135:50400/match?q=GAATAGGAGACAGAGGCGGA&k=0&no_gap=0&offset=0&limit=48
0.505 | 0.001 | cgi_end;

GGGenome by @meso_cacase at DBCLS
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