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データベース:

ミスマッチ/ギャップを許容 ミスマッチのみ許容 : 塩基まで (検索する配列長の25%まで)
双方向を検索 +方向のみ検索 -方向のみ検索

2025-04-03 19:28:08, GGGenome : DDBJ release 134.0 (Mar, 2024)

Summary:

Results:

検索語に色がつきます(ミスマッチ挿入欠失

Lutra lutra genome assembly, chromosome: 3.
LR738405.1:74828010-74828029
CACCTGTGTCCTCCGTCCTGCCTTCCTGTT74828010TCCTTCAGCATTCAGTGCAATAATTACCCTCTTCTCCCGGGGAAGCCTCT
Erebia epiphron genome assembly, chromosome: 14.
OZ009959.1:11851393-11851412
AGACAGCGTGCACCTTATTTTTTATAAAAC11851393TCCTTCAGCATTCAGTGCAAGTAAAATTCTATGGACTCCGACCAGATTTA
Lumbricus rubellus genome assembly, chromosome: 17.
OX243827.1:9234447-9234466
TTGAAGAACACAGGGACAACATATGCAGAA9234447TTGCACTGAATGCTGAAGGAATATTTAGATTAATGAATTCCAAATTTATA

Data Export:

下記のフォーマットで最大100000件まで検索結果を取得できます。

Debug Info:

Redirect URI : https://gggenome.dbcls.jp/ja/ddbj/TCCTTCAGCATTCAGTGCAA
lang : ja | db : ddbj | k : 0 | strand : | nogap : | query_string : TCCTTCAGCATTCAGTGCAA | format : html | download : | debug :

0.008 | 0.008 | search_start;
0.158 | 0.149 | search_plus_done; http://172.18.8.135:50400/match?q=TCCTTCAGCATTCAGTGCAA&k=0&no_gap=0&offset=0&limit=50
0.236 | 0.079 | search_minus_done; http://172.18.8.135:50400/match?q=TTGCACTGAATGCTGAAGGA&k=0&no_gap=0&offset=0&limit=48
0.237 | 0.001 | cgi_end;

GGGenome by @meso_cacase at DBCLS
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