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ミスマッチ/ギャップを許容 ミスマッチのみ許容 : 塩基まで (検索する配列長の25%まで)
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2025-04-05 21:01:37, GGGenome : DDBJ release 134.0 (Mar, 2024)

Summary:

Results:

検索語に色がつきます(ミスマッチ挿入欠失

TSA: Cannabis sativa PK20543.1_1.CasaPuKu mRNA sequence.
JP450170.1:433-452
TTAAAGCCCCAAAGAAGAGAGCGGAGACTT433GGGTTCAAGAAGAGACTCGAAGCTTAATTGGGTTTCGAAGAGAAGTTGAT
TSA: Cannabis sativa PK20543.2_1.CasaPuKu mRNA sequence.
JP456216.1:288-307
TTAAAGCCCCAAAGAAGAGAGCGGAGACTT288GGGTTCAAGAAGAGACTCGAAGCTTAATTGGGTTTCGAAGAGAAGTTGAT
Sisyra terminalis genome assembly, chromosome: 4.
OY292277.1:19319093-19319112
GCCTCCAACAGGACAAATCTCCTGGGGGAT19319093GGGTTCAAGAAGAGACTCGAGTAGAACCAGAAACGTGACGTATGTGAATT

Data Export:

下記のフォーマットで最大100000件まで検索結果を取得できます。

Debug Info:

Redirect URI : https://gggenome.dbcls.jp/ja/ddbj/TCGAGTCTCTTCTTGAACCC
lang : ja | db : ddbj | k : 0 | strand : | nogap : | query_string : TCGAGTCTCTTCTTGAACCC | format : html | download : | debug :

0.009 | 0.009 | search_start;
0.308 | 0.299 | search_plus_done; http://172.18.8.135:50400/match?q=TCGAGTCTCTTCTTGAACCC&k=0&no_gap=0&offset=0&limit=50
0.430 | 0.123 | search_minus_done; http://172.18.8.135:50400/match?q=GGGTTCAAGAAGAGACTCGA&k=0&no_gap=0&offset=0&limit=50
0.433 | 0.002 | cgi_end;

GGGenome by @meso_cacase at DBCLS
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