GGGenome Help | English

データベース:

ミスマッチ/ギャップを許容 ミスマッチのみ許容 : 塩基まで (検索する配列長の25%まで)
双方向を検索 +方向のみ検索 -方向のみ検索

2025-04-11 20:46:47, GGGenome : DDBJ release 134.0 (Mar, 2024)

Summary:

Results:

検索語に色がつきます(ミスマッチ挿入欠失

Lotus japonicus B-129 DNA, chromosome 1, complete sequence.
AP022629.1:136730903-136730922
ACTATCACAGTATGTGTTTCAAGATTCTCT136730903TCGCTGTTAATTTCCTATCCCCCAAACATAATAATAAGAGTAAAACCCTT
Hymenolepis microstoma genome assembly, chromosome: 3.
LR215991.1:15122276-15122295
AAAATTGAATTTGAATTTTAATTACATAGT15122276TCGCTGTTAATTTCCTATCCTATGCTTATGCCTTTTAACTGTATTCCCAA
Lotus japonicus genomic DNA, chromosome 1, clone: LjT17M09, TM0105.
AP004939.1:32384-32403
AAGGGTTTTACTCTTATTATTATGTTTGGG32384GGATAGGAAATTAACAGCGAAGAGAATCTTGAAACACATACTGTGATAGT
Lasioglossum lativentre genome assembly, chromosome: 1.
OU744355.1:27711168-27711187
CTGGCAGGATTGCAGCGTCGTCGATTACCT27711168GGATAGGAAATTAACAGCGACTGATAAGAGCACACCCGAGGAACGGATTG

Data Export:

下記のフォーマットで最大100000件まで検索結果を取得できます。

Debug Info:

Redirect URI : https://gggenome.dbcls.jp/ja/ddbj/TCGCTGTTAATTTCCTATCC
lang : ja | db : ddbj | k : 0 | strand : | nogap : | query_string : TCGCTGTTAATTTCCTATCC | format : html | download : | debug :

0.009 | 0.009 | search_start;
0.234 | 0.225 | search_plus_done; http://172.18.8.135:50400/match?q=TCGCTGTTAATTTCCTATCC&k=0&no_gap=0&offset=0&limit=50
0.368 | 0.134 | search_minus_done; http://172.18.8.135:50400/match?q=GGATAGGAAATTAACAGCGA&k=0&no_gap=0&offset=0&limit=48
0.369 | 0.001 | cgi_end;

GGGenome by @meso_cacase at DBCLS
This page is licensed under a Creative Commons Attribution 4.0 International License (CC BY 4.0).