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ミスマッチ/ギャップを許容 ミスマッチのみ許容 : 塩基まで (検索する配列長の25%まで)
双方向を検索 +方向のみ検索 -方向のみ検索

2025-04-03 12:59:37, GGGenome : DDBJ release 134.0 (Mar, 2024)

Summary:

Results:

検索語に色がつきます(ミスマッチ挿入欠失

Spinacia oleracea subsp. turkestanica cultivar PI494751 chromosome X.
CP130739.1:151812303-151812324
TTGTTGTTGTTGTATCTGAACGGGCAAACC151812303CAACCTATCATAACACACCCGACCTAGCTAAGCTCGCGACCTACTTAATGTA
Spinacia oleracea subsp. turkestanica cultivar PI494751 chromosome Y.
CP130887.1:156962848-156962869
TTGTTGTTGTTGTATCTGAACGGGCAAACC156962848CAACCTATCATAACACACCCGACCTAGCTAAGCTCGCGACCTACTTAATGTA
S. oleracera NIR gene for nitrite reductase (EC=1.7.7.1).
X17031.1:581-602
TTGTTGTTGTTGTATCTGAACGGGCAAACC581CAACCTATCATAACACACCCGACCTAGCTAAGCTCGCGACCTACTTAATGTA

Data Export:

下記のフォーマットで最大100000件まで検索結果を取得できます。

Debug Info:

Redirect URI : https://gggenome.dbcls.jp/ja/ddbj/TCGGGTGTGTTATGATAGGTTG
lang : ja | db : ddbj | k : 0 | strand : | nogap : | query_string : TCGGGTGTGTTATGATAGGTTG | format : html | download : | debug :

0.009 | 0.009 | search_start;
0.098 | 0.089 | search_plus_done; http://172.18.8.135:50400/match?q=TCGGGTGTGTTATGATAGGTTG&k=0&no_gap=0&offset=0&limit=50
0.121 | 0.023 | search_minus_done; http://172.18.8.135:50400/match?q=CAACCTATCATAACACACCCGA&k=0&no_gap=0&offset=0&limit=50
0.123 | 0.002 | cgi_end;

GGGenome by @meso_cacase at DBCLS
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