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データベース:

ミスマッチ/ギャップを許容 ミスマッチのみ許容 : 塩基まで (検索する配列長の25%まで)
双方向を検索 +方向のみ検索 -方向のみ検索

2025-04-06 00:26:25, GGGenome : DDBJ release 134.0 (Mar, 2024)

Summary:

Results:

検索語に色がつきます(ミスマッチ挿入欠失

Spinacia oleracea subsp. turkestanica cultivar PI494751 chromosome X.
CP130739.1:151812302-151812324
GTTGTTGTTGTTGTATCTGAACGGGCAAAC151812302CCAACCTATCATAACACACCCGACCTAGCTAAGCTCGCGACCTACTTAATGTA
Spinacia oleracea subsp. turkestanica cultivar PI494751 chromosome Y.
CP130887.1:156962847-156962869
GTTGTTGTTGTTGTATCTGAACGGGCAAAC156962847CCAACCTATCATAACACACCCGACCTAGCTAAGCTCGCGACCTACTTAATGTA
S. oleracera NIR gene for nitrite reductase (EC=1.7.7.1).
X17031.1:580-602
GTTGTTGTTGTTGTATCTGAACGGGCAAAC580CCAACCTATCATAACACACCCGACCTAGCTAAGCTCGCGACCTACTTAATGTA

Data Export:

下記のフォーマットで最大100000件まで検索結果を取得できます。

Debug Info:

Redirect URI : https://gggenome.dbcls.jp/ja/ddbj/TCGGGTGTGTTATGATAGGTTGG
lang : ja | db : ddbj | k : 0 | strand : | nogap : | query_string : TCGGGTGTGTTATGATAGGTTGG | format : html | download : | debug :

0.009 | 0.009 | search_start;
0.329 | 0.320 | search_plus_done; http://172.18.8.135:50400/match?q=TCGGGTGTGTTATGATAGGTTGG&k=0&no_gap=0&offset=0&limit=50
0.361 | 0.032 | search_minus_done; http://172.18.8.135:50400/match?q=CCAACCTATCATAACACACCCGA&k=0&no_gap=0&offset=0&limit=50
0.363 | 0.002 | cgi_end;

GGGenome by @meso_cacase at DBCLS
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