GGGenome Help | English

データベース：
 

ミスマッチ/ギャップを許容 ミスマッチのみ許容 ： 塩基まで (検索する配列長の25%まで)
双方向を検索 ＋方向のみ検索 －方向のみ検索

2025-04-03 20:30:44, GGGenome : DDBJ release 134.0 (Mar, 2024)

Summary:

Results:

検索語に色がつきます（ミスマッチ・挿入欠失）。

RCRCJ08TP Castor bean cDNA library from roots, 1.8 kb Ricinus communis cDNA clone RCRCJ08, mRNA sequence.
EG670576.1:392-413
TCGAGATATCGTTTTTTATGATCTTGATCT392TCGTCCTCCCTGCTTTTATTTATTTTTTGTTTTTTTTTAATTATCAGTTAAT
RCRE891TP Castor bean cDNA library from roots, 1.8 kb Ricinus communis cDNA clone RCRE891, mRNA sequence.
EG681494.1:392-413
TCGAGATATCGTTTTTTATGATCTTGATCT392TCGTCCTCCCTGCTTTTATTTATTTTTTGTTTTTTTTTAATTATCAGTTAAT
RCRAZ67TP Castor bean cDNA library from roots, 1.8 kb Ricinus communis cDNA clone RCRAZ67, mRNA sequence.
EG685612.1:392-413
TCGAGATATCGTTTTTTATGATCTTGATCT392TCGTCCTCCCTGCTTTTATTTATTTTTTGTTTTTTTTAATTATCAGTTAATA

Data Export:

下記のフォーマットで最大100000件まで検索結果を取得できます。

Debug Info:

Redirect URI : https://gggenome.dbcls.jp/ja/ddbj/TCGTCCTCCCTGCTTTTATTTA
lang : ja | db : ddbj | k : 0 | strand : | nogap : | query_string : TCGTCCTCCCTGCTTTTATTTA | format : html | download : | debug : 

0.008 | 0.008 | search_start;
0.345 | 0.337 | search_plus_done; http://172.18.8.135:50400/match?q=TCGTCCTCCCTGCTTTTATTTA&k=0&no_gap=0&offset=0&limit=50
0.440 | 0.095 | search_minus_done; http://172.18.8.135:50400/match?q=TAAATAAAAGCAGGGAGGACGA&k=0&no_gap=0&offset=0&limit=47
0.440 | 0.000 | cgi_end;

GGGenome by @meso_cacase at DBCLS
This page is licensed under a Creative Commons Attribution 4.0 International License (CC BY 4.0).