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ミスマッチ/ギャップを許容 ミスマッチのみ許容 ： 塩基まで (検索する配列長の25%まで)
双方向を検索 ＋方向のみ検索 －方向のみ検索

2025-04-03 11:28:49, GGGenome : DDBJ release 134.0 (Mar, 2024)

Summary:

Results:

検索語に色がつきます（ミスマッチ・挿入欠失）。

rni.06.F15.5 MBra685 cassava lambda zap Manihot esculenta cDNA 5', mRNA sequence.
CK643367.1:265-284
GGTGAAAGCTTGGTGAAATGGAGCTGTGAG265TACGAGAAGGCGAGCGACGACGTTGAAGTCCCACATGTGATCAAGGATTT
CV02017B2C12.f1 CV02-normalized library Manihot esculenta cDNA clone CV02017B2C12.f1, mRNA sequence.
DV455106.1:312-331
GGTGAAAGCTTGGTGAAATGGAGCTGTGAG312TACGAGAAGGCGAGCGACGACGTTGAAGTCCCACATGTGATCAAGGATTT
Nocardia iowensis strain NRRL 5646 chromosome, complete genome.
CP078145.1:7370590-7370609
CTGGTCGGCCTCGTCCACGACCTGGCCGAG7370590TACGAGAAGGCGAGCGACGAGTGCACGGTCACCGCGGCACAACTGGACAC

Data Export:

下記のフォーマットで最大100000件まで検索結果を取得できます。

Debug Info:

Redirect URI : https://gggenome.dbcls.jp/ja/ddbj/TCGTCGCTCGCCTTCTCGTA
lang : ja | db : ddbj | k : 0 | strand : | nogap : | query_string : TCGTCGCTCGCCTTCTCGTA | format : html | download : | debug : 

0.009 | 0.009 | search_start;
0.169 | 0.160 | search_plus_done; http://172.18.8.135:50400/match?q=TCGTCGCTCGCCTTCTCGTA&k=0&no_gap=0&offset=0&limit=50
0.355 | 0.186 | search_minus_done; http://172.18.8.135:50400/match?q=TACGAGAAGGCGAGCGACGA&k=0&no_gap=0&offset=0&limit=50
0.357 | 0.002 | cgi_end;

GGGenome by @meso_cacase at DBCLS
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