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ミスマッチ/ギャップを許容 ミスマッチのみ許容 ： 塩基まで (検索する配列長の25%まで)
双方向を検索 ＋方向のみ検索 －方向のみ検索

2025-03-14 16:33:28, GGGenome : DDBJ release 134.0 (Mar, 2024)

Summary:

Results:

検索語に色がつきます（ミスマッチ・挿入欠失）。

GM880013B10E01 Gm-r1088 Glycine max cDNA clone Gm-r1088-4825 3', mRNA sequence.
BU547292.1:7-29
AACAAA7TCGTTCCTAACATTCATTTTTGTAAGGCTTCTATGATATTTCACCNNNGAAAA
Glycine max cultivar Williams 82 chromosome 11.
CP126436.1:39146960-39146982
ACTCTAAGATATTTTATATAAAAAAACAAA39146960TCGTTCCTAACATTCATTTTTGTAAGGCTTCTATGATATTTCACCCGGAAAAA
Glycine max strain Williams 82 clone GM_WBb0016H11, *** SEQUENCING IN PROGRESS ***, 7 unordered pieces.
AC236142.1:37410-37432
TTTTTCCGGGTGAAATATCATAGAAGCCTT37410ACAAAAATGAATGTTAGGAACGATTTGTTTTTTTATATAAAATATCTTAGAGT

Data Export:

下記のフォーマットで最大100000件まで検索結果を取得できます。

Debug Info:

Redirect URI : https://gggenome.dbcls.jp/ja/ddbj/TCGTTCCTAACATTCATTTTTGT
lang : ja | db : ddbj | k : 0 | strand : | nogap : | query_string : TCGTTCCTAACATTCATTTTTGT | format : html | download : | debug : 

0.009 | 0.009 | search_start;
0.304 | 0.295 | search_plus_done; http://172.18.8.135:50400/match?q=TCGTTCCTAACATTCATTTTTGT&k=0&no_gap=0&offset=0&limit=50
0.426 | 0.122 | search_minus_done; http://172.18.8.135:50400/match?q=ACAAAAATGAATGTTAGGAACGA&k=0&no_gap=0&offset=0&limit=48
0.427 | 0.001 | cgi_end;

GGGenome by @meso_cacase at DBCLS
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