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データベース:

ミスマッチ/ギャップを許容 ミスマッチのみ許容 : 塩基まで (検索する配列長の25%まで)
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2025-12-17 08:22:58, GGGenome : DDBJ release 138.0 (Jun, 2025)

Summary:

Results:

検索語に色がつきます(ミスマッチ挿入欠失

Lentilactobacillus curieae strain CCTCC M 2011381, complete genome.
CP018906.1:2057704-2057723
CGCGCTTGGCGACTAGCATTAGCAATCTCT2057704TCGTTGCTTGAAACATAGCGATTAGAGTACTGAAGTGCTTGTTCAGCCAA
Arabidopsis arenosa genome assembly, chromosome: 5.
LR999455.1:3686630-3686649
TGGCAGAACCGAACAAGGAGTTTCATTGCT3686630CGCTATGTTTCAAGCAACGATACATGCCATTTGGCTGGAACGAAACGAAA

Data Export:

下記のフォーマットで最大100000件まで検索結果を取得できます。

Debug Info:

Redirect URI : https://gggenome.dbcls.jp/ja/ddbj/TCGTTGCTTGAAACATAGCG
lang : ja | db : ddbj | k : 0 | strand : | nogap : | query_string : TCGTTGCTTGAAACATAGCG | format : html | download : | debug :

0.009 | 0.009 | search_start;
0.236 | 0.227 | search_plus_done; http://172.18.8.135:50800/match?q=TCGTTGCTTGAAACATAGCG&k=0&no_gap=0&offset=0&limit=50
0.334 | 0.098 | search_minus_done; http://172.18.8.135:50800/match?q=CGCTATGTTTCAAGCAACGA&k=0&no_gap=0&offset=0&limit=49
0.334 | 0.001 | cgi_end;

GGGenome by @meso_cacase at DBCLS
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