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ミスマッチ/ギャップを許容 ミスマッチのみ許容 : 塩基まで (検索する配列長の25%まで)
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2025-04-05 20:04:28, GGGenome : DDBJ release 134.0 (Mar, 2024)

Summary:

Results:

検索語に色がつきます(ミスマッチ挿入欠失

TSA: Capsicum annuum MGMT_Contig42143 mRNA sequence.
JW092387.1:974-993
GGTAGTGATACTAATAAGGTCTACACACAC974TCTATCATCCCCAGATCCCACTTGTGGGATTTCAC
Capsicum annuum Takanotsume DNA, chromosome 2, sequence.
AP026697.1:167011764-167011783
GGTAGTGATACTAATAAGGTCTACACACAC167011764TCTATCATCCCCAGATCCCACTTGTGGGATTTCACTGGGTATGTTGTTGT
Capsicum annuum cultivar G1-36576 isolate CaT2T chromosome 2.
CP124730.1:167716980-167716999
GGTAGTGATACTAATAAGGTCTACACACAC167716980TCTATCATCCCCAGATCCCACTTGTGGGATTTCACTGGGTATGTTGTTGT
Vicia faba genome assembly, chromosome: 4.
OX451739.1:278127364-278127383
CCATGGGCCAACCACATCATCACCATCAGA278127364TCTATCATCCCCAGATCCCACGCCCCTGGAAACGCTTCCATACCATGGAC

Data Export:

下記のフォーマットで最大100000件まで検索結果を取得できます。

Debug Info:

Redirect URI : https://gggenome.dbcls.jp/ja/ddbj/TCTATCATCCCCAGATCCCA
lang : ja | db : ddbj | k : 0 | strand : | nogap : | query_string : TCTATCATCCCCAGATCCCA | format : html | download : | debug :

0.009 | 0.009 | search_start;
0.380 | 0.372 | search_plus_done; http://172.18.8.135:50400/match?q=TCTATCATCCCCAGATCCCA&k=0&no_gap=0&offset=0&limit=50
0.486 | 0.105 | search_minus_done; http://172.18.8.135:50400/match?q=TGGGATCTGGGGATGATAGA&k=0&no_gap=0&offset=0&limit=46
0.486 | 0.000 | cgi_end;

GGGenome by @meso_cacase at DBCLS
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