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ミスマッチ/ギャップを許容 ミスマッチのみ許容 ： 塩基まで (検索する配列長の25%まで)
双方向を検索 ＋方向のみ検索 －方向のみ検索

2025-04-09 09:10:03, GGGenome : DDBJ release 134.0 (Mar, 2024)

Summary:

Results:

検索語に色がつきます（ミスマッチ・挿入欠失）。

KS20003F07 KS20 Capsicum annuum cDNA, mRNA sequence.
GD093605.1:236-255
TTCTACTGTGGTAAGACAAAGGATTTGATG236TCTCGACAAAGTTTGACCCAATCCAATAGTTAAGAAGTGGCCAATCAAAT
TSA: Capsicum annuum MGMT_Contig1512, mRNA sequence.
JW051756.1:93-112
TTCTACTGTGGTAAGACAAAGGATTTGATG93TCTCGACAAAGTTTGACCCAATCCAATAGTTAAGAAGTGGCCAATCAAAT
Capsicum rhomboideum cultivar Andean isolate CrT2T chromosome 4.
CP124716.1:41405136-41405155
TTGTGTCAGGTGAAGACAAAGGATTTGATG41405136TCTCGACAAAGTTTGACCCAATCCAATTGTTATGAAGTGGCCAATCAAAT
Capsicum annuum Takanotsume DNA, chromosome 3, sequence.
AP026698.1:165087116-165087135
ATTTGATTGGCCACTTCTTAACTATTGGAT165087116TGGGTCAAACTTTGTCGAGACATCAAATCCTTTGTCTTACCACAGTAGAA
Capsicum annuum cultivar G1-36576 isolate CaT2T chromosome 3.
CP124729.1:125311421-125311440
ATTTGATTGGCCACTTCTTAACTATTGGAT125311421TGGGTCAAACTTTGTCGAGACATCAAATCCTTTGTCTTACCACAGTAGAA

Data Export:

下記のフォーマットで最大100000件まで検索結果を取得できます。

Debug Info:

Redirect URI : https://gggenome.dbcls.jp/ja/ddbj/TCTCGACAAAGTTTGACCCA
lang : ja | db : ddbj | k : 0 | strand : | nogap : | query_string : TCTCGACAAAGTTTGACCCA | format : html | download : | debug : 

0.009 | 0.009 | search_start;
0.457 | 0.448 | search_plus_done; http://172.18.8.135:50400/match?q=TCTCGACAAAGTTTGACCCA&k=0&no_gap=0&offset=0&limit=50
0.549 | 0.093 | search_minus_done; http://172.18.8.135:50400/match?q=TGGGTCAAACTTTGTCGAGA&k=0&no_gap=0&offset=0&limit=47
0.551 | 0.002 | cgi_end;

GGGenome by @meso_cacase at DBCLS
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