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ミスマッチ/ギャップを許容 ミスマッチのみ許容 ： 塩基まで (検索する配列長の25%まで)
双方向を検索 ＋方向のみ検索 －方向のみ検索

2025-04-03 11:44:21, GGGenome : DDBJ release 134.0 (Mar, 2024)

Summary:

Results:

検索語に色がつきます（ミスマッチ・挿入欠失）。

Brassica napus genome assembly, chromosome: A06.
HG994360.1:40693134-40693154
AATTTCTTTAATATCTCCATATATTCTCTT40693134TCTCTCACAATGTGGGTAGGTAAAAATGAGTACATCATTTATGAATGATAT
Brassica rapa isolate C634 glabra 1 (GL1) gene, partial cds.
HQ162470.1:935-955
AATTTCTTTAATATCTCCATATATTCTCTT935TCTCTCACAATGTGGGTAGGTAAAAATGAATACATCATTTATGAATGATAT
Brassica rapa subsp. pekinensis cultivar Inbred line 'Chiifu' clone KBrS004A14, complete sequence.
AC189633.2:76875-76895
ATATCATTCATAAATGATGTACTCATTTTT76875ACCTACCCACATTGTGAGAGAAAGAGAATATATGGAGATATTAAAGAAATT

Data Export:

下記のフォーマットで最大100000件まで検索結果を取得できます。

Debug Info:

Redirect URI : https://gggenome.dbcls.jp/ja/ddbj/TCTCTCACAATGTGGGTAGGT
lang : ja | db : ddbj | k : 0 | strand : | nogap : | query_string : TCTCTCACAATGTGGGTAGGT | format : html | download : | debug : 

0.009 | 0.009 | search_start;
0.183 | 0.174 | search_plus_done; http://172.18.8.135:50400/match?q=TCTCTCACAATGTGGGTAGGT&k=0&no_gap=0&offset=0&limit=50
0.269 | 0.086 | search_minus_done; http://172.18.8.135:50400/match?q=ACCTACCCACATTGTGAGAGA&k=0&no_gap=0&offset=0&limit=48
0.270 | 0.001 | cgi_end;

GGGenome by @meso_cacase at DBCLS
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