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データベース:

ミスマッチ/ギャップを許容 ミスマッチのみ許容 : 塩基まで (検索する配列長の25%まで)
双方向を検索 +方向のみ検索 -方向のみ検索

2025-04-03 20:28:08, GGGenome : DDBJ release 134.0 (Mar, 2024)

Summary:

Results:

検索語に色がつきます(ミスマッチ挿入欠失

Musa acuminata subsp. malaccensis isolate AA chromosome 10.
CP126379.1:31578186-31578205
GCTGGCCTCCGCTCCGTGAAAGAGAACAGC31578186TTCATCGTACGCGACAGAGAGGAGAGGAAGAGGCAGAAGGCCGACGGGGA
Musa acuminata subsp. malaccensis isolate AA chromosome 21.
CP126390.1:35287050-35287069
GCTGGCCTCCGCTCCGTGAAAGAGAACAGC35287050TTCATCGTACGCGACAGAGAGGAGAGGAAGAGGCAGAAGGCCGACGGGGA

Data Export:

下記のフォーマットで最大100000件まで検索結果を取得できます。

Debug Info:

Redirect URI : https://gggenome.dbcls.jp/ja/ddbj/TCTCTGTCGCGTACGATGAA
lang : ja | db : ddbj | k : 0 | strand : | nogap : | query_string : TCTCTGTCGCGTACGATGAA | format : html | download : | debug :

0.009 | 0.009 | search_start;
0.326 | 0.317 | search_plus_done; http://172.18.8.135:50400/match?q=TCTCTGTCGCGTACGATGAA&k=0&no_gap=0&offset=0&limit=50
0.407 | 0.081 | search_minus_done; http://172.18.8.135:50400/match?q=TTCATCGTACGCGACAGAGA&k=0&no_gap=0&offset=0&limit=50
0.408 | 0.002 | cgi_end;

GGGenome by @meso_cacase at DBCLS
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