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ミスマッチ/ギャップを許容 ミスマッチのみ許容 ： 塩基まで (検索する配列長の25%まで)
双方向を検索 ＋方向のみ検索 －方向のみ検索

2025-04-08 04:50:45, GGGenome : DDBJ release 134.0 (Mar, 2024)

Summary:

Results:

検索語に色がつきます（ミスマッチ・挿入欠失）。

Microcaecilia unicolor genome assembly, chromosome: 10.
LR594641.1:4361625-4361644
AACTCCCAAATTAAAAGTAAAAGCAGAAGC4361625TCTGGTGAATCCTCTGCCTTAGAAAAGCTAAGAAAGCAAATAGAATGTTA
Solanum pennellii chromosome ch08, complete genome.
HG975447.1:30494823-30494842
CCCTTGAAGAAGATTCTAATTTGACCAAGC30494823TCTGGTGAATCCTCTGCCTTTGACTATGGCTTCCCATCTAAGGGATTTCA
Pipistrellus pipistrellus genome assembly, chromosome: 6.
LR862362.1:32524359-32524378
AATAAATAATAGAGGGTTCTGGAAGACTGA32524359AAGGCAGAGGATTCACCAGAGGACCTAATAGCTATGGGAAGCATATCTTT
Mastacembelus armatus genome assembly, chromosome: 24.
LR535856.1:13445590-13445609
TGAATCATATTCATATTTGCAAATAAATTA13445590AAGGCAGAGGATTCACCAGATGACTTCTTAAACTAGCAAGGAACAGTAAT
Geotrypetes seraphini genome assembly, chromosome: 11.
LR699156.1:125743922-125743941
GAAAGAGCCATTTGTAAAGAACCTCTTTCC125743922AAGGCAGAGGATTCACCAGAGATACTACCACTTCTACCACTAAAATAGAC

Data Export:

下記のフォーマットで最大100000件まで検索結果を取得できます。

Debug Info:

Redirect URI : https://gggenome.dbcls.jp/ja/ddbj/TCTGGTGAATCCTCTGCCTT
lang : ja | db : ddbj | k : 0 | strand : | nogap : | query_string : TCTGGTGAATCCTCTGCCTT | format : html | download : | debug : 

0.009 | 0.009 | search_start;
0.356 | 0.347 | search_plus_done; http://172.18.8.135:50400/match?q=TCTGGTGAATCCTCTGCCTT&k=0&no_gap=0&offset=0&limit=50
0.450 | 0.094 | search_minus_done; http://172.18.8.135:50400/match?q=AAGGCAGAGGATTCACCAGA&k=0&no_gap=0&offset=0&limit=48
0.452 | 0.002 | cgi_end;

GGGenome by @meso_cacase at DBCLS
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