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データベース：
 

ミスマッチ/ギャップを許容 ミスマッチのみ許容 ： 塩基まで (検索する配列長の25%まで)
双方向を検索 ＋方向のみ検索 －方向のみ検索

2025-04-03 12:46:15, GGGenome : DDBJ release 134.0 (Mar, 2024)

Summary:

Results:

検索語に色がつきます（ミスマッチ・挿入欠失）。

TSA: Cannabis sativa PK16477.1_1.CasaPuKu mRNA sequence.
JP449674.1:2524-2543
CTTGGAATATGCACTCCAGCTTCAGGAATC2524TGAACCACAGACTCAACAGGAAGAAGTTGGCAATGTCGATTCGCAGCAGC
TSA: Humulus lupulus var. lupulus mRNA, contig: comp288070_c0_seq1.
LA477958.1:834-853
GCTCCTGCAAATCGACATTGCCAACTTCTT834CCTGTTGAGTCTGTGGTTCAGACTCCTGAAGCTGAAGTGCATATTCCAAA
TSA: Humulus lupulus var. lupulus mRNA, contig: comp288070_c0_seq2.
LA477959.1:847-866
GCTCCTGCAAATCGACATTGCCAACTTCTT847CCTGTTGAGTCTGTGGTTCAGACTCCTGAAGCTGAAGTGCATATTCCAAA
Humulus lupulus genome assembly, chromosome: 5.
OY720652.1:27324247-27324266
GCTCCTGCGAATCGACATTGCCAACTTCTT27324247CCTGTTGAGTCTGTGGTTCAGACTCCTGAAGCTGAAGTGCATATTCCAAA
Merodon equestris genome assembly, chromosome: 6.
OY284418.1:3899341-3899360
AGGTGGTCGTGGTCATCACCGACTGTTGAG3899341CCTGTTGAGTCTGTGGTTCAAGTCTGTCCATAGTCAAAAACAATTCCTAT

Data Export:

下記のフォーマットで最大100000件まで検索結果を取得できます。

Debug Info:

Redirect URI : https://gggenome.dbcls.jp/ja/ddbj/TGAACCACAGACTCAACAGG
lang : ja | db : ddbj | k : 0 | strand : | nogap : | query_string : TGAACCACAGACTCAACAGG | format : html | download : | debug : 

0.009 | 0.009 | search_start;
0.174 | 0.165 | search_plus_done; http://172.18.8.135:50400/match?q=TGAACCACAGACTCAACAGG&k=0&no_gap=0&offset=0&limit=50
0.297 | 0.123 | search_minus_done; http://172.18.8.135:50400/match?q=CCTGTTGAGTCTGTGGTTCA&k=0&no_gap=0&offset=0&limit=49
0.299 | 0.003 | cgi_end;

GGGenome by @meso_cacase at DBCLS
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