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ミスマッチ/ギャップを許容 ミスマッチのみ許容 : 塩基まで (検索する配列長の25%まで)
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2025-04-03 19:25:39, GGGenome : DDBJ release 134.0 (Mar, 2024)

Summary:

Results:

検索語に色がつきます(ミスマッチ挿入欠失

QGF25D22.yg.ab1 QG_EFGHJ lettuce serriola Lactuca serriola cDNA clone QGF25D22, mRNA sequence.
BQ992296.1:234-256
TTACCTAAAGTTAGCTGTGCAAGATTTCAA234TGAATGCCAATCTATCTATCGTGAAGAACTAAAAGATCTTGAAAGGTGGGTGG
TSA: Lactuca serriola Serrassy_T_P2_12378 mRNA sequence.
JO022969.1:1614-1636
TTACCTAAAGTTAGCTGTGCAAGATTTCAA1614TGAATGCCAATCTATCTATCGTGAAGAACTAAAAGATCTTGAAAGGTGGGTGG

Data Export:

下記のフォーマットで最大100000件まで検索結果を取得できます。

Debug Info:

Redirect URI : https://gggenome.dbcls.jp/ja/ddbj/TGAATGCCAATCTATCTATCGTG
lang : ja | db : ddbj | k : 0 | strand : | nogap : | query_string : TGAATGCCAATCTATCTATCGTG | format : html | download : | debug :

0.008 | 0.008 | search_start;
0.354 | 0.346 | search_plus_done; http://172.18.8.135:50400/match?q=TGAATGCCAATCTATCTATCGTG&k=0&no_gap=0&offset=0&limit=50
0.440 | 0.086 | search_minus_done; http://172.18.8.135:50400/match?q=CACGATAGATAGATTGGCATTCA&k=0&no_gap=0&offset=0&limit=48
0.440 | 0.000 | cgi_end;

GGGenome by @meso_cacase at DBCLS
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