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ミスマッチ/ギャップを許容 ミスマッチのみ許容 ： 塩基まで (検索する配列長の25%まで)
双方向を検索 ＋方向のみ検索 －方向のみ検索

2025-04-03 13:35:01, GGGenome : DDBJ release 134.0 (Mar, 2024)

Summary:

Results:

検索語に色がつきます（ミスマッチ・挿入欠失）。

Bugulina stolonifera genome assembly, chromosome: 7.
OW285193.1:13945298-13945317
CCAAATACACTTGTTACATCATGTTATGAC13945298TGAATTCAGATGGGGAAGTGGATGACTGTATTTTATGATTAAAAAAGCTA
Pseudochaenichthys georgianus genome assembly, chromosome: 1.
LR792546.1:485096-485115
TAAATGCGTACATTAACAGTTTTATGATAT485096CACTTCCCCATCTGAATTCAATTATATTTGAGTGTTTCGTCAACTTAAAG
Trifolium pratense DNA, clone:RC0475f.ab1.
DE245477.1:438-457
AATTTATTTATCAAACCTGAAGCATGATTA438CACTTCCCCATCTGAATTCATCCATCAATGTTGGATGTTTGTCGCCAATT
Halobacillus litoralis strain ERB 031 chromosome, complete genome.
CP026118.1:1810314-1810333
TTACTATCTCGTTGACTCATTACTTCACCC1810314CACTTCCCCATCTGAATTCATCTGCTCAATCACCGTAACTTCCTCATAAG

Data Export:

下記のフォーマットで最大100000件まで検索結果を取得できます。

Debug Info:

Redirect URI : https://gggenome.dbcls.jp/ja/ddbj/TGAATTCAGATGGGGAAGTG
lang : ja | db : ddbj | k : 0 | strand : | nogap : | query_string : TGAATTCAGATGGGGAAGTG | format : html | download : | debug : 

0.008 | 0.008 | search_start;
0.319 | 0.311 | search_plus_done; http://172.18.8.135:50400/match?q=TGAATTCAGATGGGGAAGTG&k=0&no_gap=0&offset=0&limit=50
0.452 | 0.133 | search_minus_done; http://172.18.8.135:50400/match?q=CACTTCCCCATCTGAATTCA&k=0&no_gap=0&offset=0&limit=49
0.454 | 0.002 | cgi_end;

GGGenome by @meso_cacase at DBCLS
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