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データベース:

ミスマッチ/ギャップを許容 ミスマッチのみ許容 : 塩基まで (検索する配列長の25%まで)
双方向を検索 +方向のみ検索 -方向のみ検索

2025-04-05 21:57:49, GGGenome : DDBJ release 134.0 (Mar, 2024)

Summary:

Results:

検索語に色がつきます(ミスマッチ挿入欠失

Solanum melongena mRNA, clone: SmFL10A18, 3'end.
FS072809.1:49-68
CAATTGATATGACTAAATCTTCAGGGACAA49TGACATGTAGCTGGGCAGAGCATGAAGGTACGAGGGTACAAACAGATTGC
Solanum melongena mRNA, clone: SmFL11F16, 3'end.
FS073757.1:51-70
CAATTGATATGACTAAATCTTCAGGGACAA51TGACATGTAGCTGGGCAGAGCATGAAGGTACGAGGGTACAAACAGATTGC
Solanum melongena mRNA, clone: SmFL12P08, 3'end.
FS074889.1:51-70
CAATTGATATGACTAAATCTTCAGGGACAA51TGACATGTAGCTGGGCAGAGCATGAAGGTACGAGGGTACAAACAGATTGC
Solanum melongena mRNA, clone: SmFL35B23, 3'end.
FS090240.1:38-57
CAATTGATATGACTAAATCTTCAGGGACAA38TGACATGTAGCTGGGCAGAGCATGAAGGTACGAGGGTACAAACAGATTGC

Data Export:

下記のフォーマットで最大100000件まで検索結果を取得できます。

Debug Info:

Redirect URI : https://gggenome.dbcls.jp/ja/ddbj/TGACATGTAGCTGGGCAGAG
lang : ja | db : ddbj | k : 0 | strand : | nogap : | query_string : TGACATGTAGCTGGGCAGAG | format : html | download : | debug :

0.008 | 0.008 | search_start;
0.821 | 0.812 | search_plus_done; http://172.18.8.135:50400/match?q=TGACATGTAGCTGGGCAGAG&k=0&no_gap=0&offset=0&limit=50
0.933 | 0.112 | search_minus_done; http://172.18.8.135:50400/match?q=CTCTGCCCAGCTACATGTCA&k=0&no_gap=0&offset=0&limit=46
0.933 | 0.000 | cgi_end;

GGGenome by @meso_cacase at DBCLS
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