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ミスマッチ/ギャップを許容 ミスマッチのみ許容 ： 塩基まで (検索する配列長の25%まで)
双方向を検索 ＋方向のみ検索 －方向のみ検索

2025-04-08 15:28:15, GGGenome : DDBJ release 134.0 (Mar, 2024)

Summary:

Results:

検索語に色がつきます（ミスマッチ・挿入欠失）。

LjNEST43g8r Lotus japonicus nodule library 5 and 7 week-old Lotus japonicus cDNA 5', mRNA sequence.
BI418619.1:4-27
TAT4TGATTCTTGAAGATTTAAAAGATGACCCTTCTCATTCTCAAACTCTAAACCCTC
Lotus japonicus genomic DNA, chromosome 3, clone: LjT06J16, TM0083.
AP004929.1:97075-97098
TTCATAAAAAAAAGAATAAACCCAAAATAT97075TGATTCTTGAAGATTTAAAAGATGACCCTTCTCATTCTCAAACTCTAAACCCTC
Lotus japonicus B-129 DNA, chromosome 3, complete sequence.
AP022631.1:70185497-70185520
GAGGGTTTAGAGTTTGAGAATGAGAAGGGT70185497CATCTTTTAAATCTTCAAGAATCAATATTTTGGGTTTATTCTTTTTTTTATGAA

Data Export:

下記のフォーマットで最大100000件まで検索結果を取得できます。

Debug Info:

Redirect URI : https://gggenome.dbcls.jp/ja/ddbj/TGATTCTTGAAGATTTAAAAGATG
lang : ja | db : ddbj | k : 0 | strand : | nogap : | query_string : TGATTCTTGAAGATTTAAAAGATG | format : html | download : | debug : 

0.009 | 0.009 | search_start;
0.375 | 0.366 | search_plus_done; http://172.18.8.135:50400/match?q=TGATTCTTGAAGATTTAAAAGATG&k=0&no_gap=0&offset=0&limit=50
0.485 | 0.111 | search_minus_done; http://172.18.8.135:50400/match?q=CATCTTTTAAATCTTCAAGAATCA&k=0&no_gap=0&offset=0&limit=48
0.486 | 0.001 | cgi_end;

GGGenome by @meso_cacase at DBCLS
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