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データベース:

ミスマッチ/ギャップを許容 ミスマッチのみ許容 : 塩基まで (検索する配列長の25%まで)
双方向を検索 +方向のみ検索 -方向のみ検索

2025-04-03 15:00:31, GGGenome : DDBJ release 134.0 (Mar, 2024)

Summary:

Results:

検索語に色がつきます(ミスマッチ挿入欠失

Trifolium pratense DNA, clone:RCG01882.
DE213617.1:11-30
CAGTCGAATT11TGCACCCATCAAGTGTTTGTGAAAATGCCTAAACCTAAATCCACCGATGC
Trifolium pratense DNA, clone:RCG01985.
DE213702.1:11-30
CAGTCGAATT11TGCACCCATCAAGTGTTTGTGAAAATGCCTAAACCTAAATCCACCGATGC
Trifolium pratense DNA, clone:RCG02252.
DE213912.1:11-30
CAGTCGAATT11TGCACCCATCAAGTGTTTGTGGAAATGCCTAAACCTAAATCCACCGATGC
Bufo bufo genome assembly, chromosome: 10.
LR991676.1:54407136-54407155
GGATTACTGAGATTTTTATTGAAAGCATCA54407136ACAAACACTTGATGGGTGCAAAGTCACTAAACACAGAAATTAGGTCATCG
Trifolium pratense DNA, clone:RCG02748.
DE214305.1:170-189
GCATCGGTGGATTTAGGTTTAGGCATTTTC170ACAAACACTTGATGGGTGCAAATTCGACTG
Trifolium pratense DNA, clone:RCG03929.
DE215271.1:170-189
GCATCGGTGGATTTAGGTTTAGGCATTTTC170ACAAACACTTGATGGGTGCAAATTCGACTG
Trifolium pratense DNA, clone:RCG01068.
DE246714.1:170-189
GCATCGGTGGATTTAGGTTTAGGCATTTTC170ACAAACACTTGATGGGTGCAAATTCGACTG

Data Export:

下記のフォーマットで最大100000件まで検索結果を取得できます。

Debug Info:

Redirect URI : https://gggenome.dbcls.jp/ja/ddbj/TGCACCCATCAAGTGTTTGT
lang : ja | db : ddbj | k : 0 | strand : | nogap : | query_string : TGCACCCATCAAGTGTTTGT | format : html | download : | debug :

0.009 | 0.009 | search_start;
0.230 | 0.221 | search_plus_done; http://172.18.8.135:50400/match?q=TGCACCCATCAAGTGTTTGT&k=0&no_gap=0&offset=0&limit=50
0.383 | 0.152 | search_minus_done; http://172.18.8.135:50400/match?q=ACAAACACTTGATGGGTGCA&k=0&no_gap=0&offset=0&limit=47
0.385 | 0.003 | cgi_end;

GGGenome by @meso_cacase at DBCLS
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