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ミスマッチ/ギャップを許容 ミスマッチのみ許容 ： 塩基まで (検索する配列長の25%まで)
双方向を検索 ＋方向のみ検索 －方向のみ検索

2025-04-03 15:21:47, GGGenome : DDBJ release 134.0 (Mar, 2024)

Summary:

Results:

検索語に色がつきます（ミスマッチ・挿入欠失）。

Populus trichocarpa clone ACSB1145-L17, complete sequence.
AC214277.1:34838-34858
GAGTTATCATTACACCTTTAGCATCACCAG34838TTGACCCTGAAGTGAACTGCAGAAAACACAAATCATCCGGCTGACATTCAG
Populus nigra genome assembly, chromosome: 8.
OX637679.1:20980708-20980728
GAGTTATCATTACACCTTTAGCATCGCCAG20980708TTGACCCTGAAGTGAACTGCAGAAAACACAAATCATCCGGCTGAGATTCAG
Populus nigra genome assembly, chromosome: 8.
OX637679.1:21008642-21008662
GAGTTATCATTACACCTTTAGCATCTCCAG21008642TTGACCCTGAAGTGAACTGCAGAAAACACAAATCCTCCGGCTGAGATTCAG

Data Export:

下記のフォーマットで最大100000件まで検索結果を取得できます。

Debug Info:

Redirect URI : https://gggenome.dbcls.jp/ja/ddbj/TGCAGTTCACTTCAGGGTCAA
lang : ja | db : ddbj | k : 0 | strand : | nogap : | query_string : TGCAGTTCACTTCAGGGTCAA | format : html | download : | debug : 

0.009 | 0.009 | search_start;
0.106 | 0.097 | search_plus_done; http://172.18.8.135:50400/match?q=TGCAGTTCACTTCAGGGTCAA&k=0&no_gap=0&offset=0&limit=50
0.129 | 0.023 | search_minus_done; http://172.18.8.135:50400/match?q=TTGACCCTGAAGTGAACTGCA&k=0&no_gap=0&offset=0&limit=50
0.132 | 0.002 | cgi_end;

GGGenome by @meso_cacase at DBCLS
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