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ミスマッチ/ギャップを許容 ミスマッチのみ許容 ： 塩基まで (検索する配列長の25%まで)
双方向を検索 ＋方向のみ検索 －方向のみ検索

2025-04-03 15:26:55, GGGenome : DDBJ release 134.0 (Mar, 2024)

Summary:

Results:

検索語に色がつきます（ミスマッチ・挿入欠失）。

EG-A11_006_E06 Oil palm abnormal apex Lambda Zap Library Elaeis guineensis cDNA, mRNA sequence.
CN600053.1:42-60
TCTTCCTTCTTGTTGCCCCTTGTGTTACTC42TGCTAGAAGTCTCCCCACTCCTCTCTCTCTCTACCCTATCAATAAAATG
EoEST2032 Oil palm mesocarp-tissue cDNA Entry Library Elaeis oleifera cDNA clone Mo17-2165 5' similar to Unknown protein, mRNA sequence.
ES323762.1:4-22
CTC4TGCTAGAAGTCTCCCCACTCCTCTCTCTCTCTCTCTACCCTATCAATAA
Ovis canadensis canadensis isolate 43U chromosome 15 sequence.
CP011900.1:46151410-46151428
TCTGTAGGATGTTTTAAAGGGACTTGTCCC46151410AGTGGGGAGACTTCTAGCATGATCTATGACGGGGGAAGCCTCTATGTCT
Apteryx australis mantelli genome assembly, scaffold: scaffold158.
LK065234.1:4237039-4237057
ACCTGTTGCACCCTGTCCTGCTGTGATGCC4237039AGTGGGGAGACTTCTAGCAGTGTCAAGCCAGGTTTTGACTGCTGCTTTG

Data Export:

下記のフォーマットで最大100000件まで検索結果を取得できます。

Debug Info:

Redirect URI : https://gggenome.dbcls.jp/ja/ddbj/TGCTAGAAGTCTCCCCACT
lang : ja | db : ddbj | k : 0 | strand : | nogap : | query_string : TGCTAGAAGTCTCCCCACT | format : html | download : | debug : 

0.009 | 0.009 | search_start;
0.329 | 0.320 | search_plus_done; http://172.18.8.135:50400/match?q=TGCTAGAAGTCTCCCCACT&k=0&no_gap=0&offset=0&limit=50
0.419 | 0.091 | search_minus_done; http://172.18.8.135:50400/match?q=AGTGGGGAGACTTCTAGCA&k=0&no_gap=0&offset=0&limit=48
0.421 | 0.001 | cgi_end;

GGGenome by @meso_cacase at DBCLS
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