GGGenome Help | English

データベース:

ミスマッチ/ギャップを許容 ミスマッチのみ許容 : 塩基まで (検索する配列長の25%まで)
双方向を検索 +方向のみ検索 -方向のみ検索

2025-04-03 08:07:45, GGGenome : DDBJ release 134.0 (Mar, 2024)

Summary:

Results:

検索語に色がつきます(ミスマッチ挿入欠失

Arachis hypogaea DNA, clone: NYHA00A06, cultivar: Nakateyutaka.
DE998911.1:457-476
ATAGATCTTTAGGATTACTTTCTTTTTTTT457TGCTGCGTGTTATGAAGACATAGTAATCCTTCAGATACTACAATGAAGAC
Arachis hypogaea cultivar Shitouqi chromosome A01.
CP030983.1:35541235-35541254
ATAGATCTTTAGGATTACTTTCTTTTTTTT35541235TGCTGCGTGTTATGAAGACATAGTAATCCTTCAGATACTACAATGAAGAC
Arachis hypogaea cultivar Shitouqi chromosome A10.
CP030992.1:60655391-60655410
AGATCTTTAGGATTACTTTCTTTTTTCTTC60655391TGCTGCGTGTTATGAAGACATGGTAATCCATCAATAAATACTTGTTTTGC

Data Export:

下記のフォーマットで最大100000件まで検索結果を取得できます。

Debug Info:

Redirect URI : https://gggenome.dbcls.jp/ja/ddbj/TGCTGCGTGTTATGAAGACA
lang : ja | db : ddbj | k : 0 | strand : | nogap : | query_string : TGCTGCGTGTTATGAAGACA | format : html | download : | debug :

0.009 | 0.009 | search_start;
0.265 | 0.256 | search_plus_done; http://172.18.8.135:50400/match?q=TGCTGCGTGTTATGAAGACA&k=0&no_gap=0&offset=0&limit=50
0.371 | 0.106 | search_minus_done; http://172.18.8.135:50400/match?q=TGTCTTCATAACACGCAGCA&k=0&no_gap=0&offset=0&limit=47
0.371 | 0.000 | cgi_end;

GGGenome by @meso_cacase at DBCLS
This page is licensed under a Creative Commons Attribution 4.0 International License (CC BY 4.0).