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データベース：
 

ミスマッチ/ギャップを許容 ミスマッチのみ許容 ： 塩基まで (検索する配列長の25%まで)
双方向を検索 ＋方向のみ検索 －方向のみ検索

2025-04-03 18:52:31, GGGenome : DDBJ release 134.0 (Mar, 2024)

Summary:

Results:

検索語に色がつきます（ミスマッチ・挿入欠失）。

Sequence 785 from patent US 8426682.
GZ836566.1:317-338
GAGCCAGACTGATCCTGCTAAGAATTCTGA317TGCTTGTGGCGGTGTTGGTATTCTCGGTATTGCATGGGCCTTCGGCGGCATG
Sequence 785 from Patent WO2009083958.
HB466064.1:317-338
GAGCCAGACTGATCCTGCTAAGAATTCTGA317TGCTTGTGGCGGTGTTGGTATTCTCGGTATTGCATGGGCCTTCGGCGGCATG
Sequence 785 from patent US 9670501.
KH776206.1:317-338
GAGCCAGACTGATCCTGCTAAGAATTCTGA317TGCTTGTGGCGGTGTTGGTATTCTCGGTATTGCATGGGCCTTCGGCGGCATG
Sequence 785 from patent US 10407690.
MO362368.1:317-338
GAGCCAGACTGATCCTGCTAAGAATTCTGA317TGCTTGTGGCGGTGTTGGTATTCTCGGTATTGCATGGGCCTTCGGCGGCATG
Sequence 14963 from patent US 10766935.
MV658358.1:312-333
GAGCCAGACTGATCCTGCTAAGAATTCTGA312TGCTTGTGGCGGTGTTGGTATTCTCGGTATTGCATGGGCCTTCGGCGGCATG
Sequence 14963 from patent US 11566053.
OS281837.1:312-333
GAGCCAGACTGATCCTGCTAAGAATTCTGA312TGCTTGTGGCGGTGTTGGTATTCTCGGTATTGCATGGGCCTTCGGCGGCATG
Manihot esculenta mRNA, clone: CAS01_009_H11, 5'end.
DB923098.1:233-254
GAGCCAGACTGATCCTGCTAAGAATTCTGA233TGCTTGTGGCGGTGTTGGTATTCTCGGTATTGCATGGGCCTTCGGCGGCATG
Manihot esculenta mRNA, clone: CAS01_037_F04, 5'end.
DB933199.1:309-330
GAGCCAGACTGATCCTGCTAAGAATTCTGA309TGCTTGTGGCGGTGTTGGTATTCTCGGTATTGCATGGGCCTTCGGCGGCATG
CAST106B02 cassava tuber Manihot esculenta cDNA clone CAST106B02, mRNA sequence.
DR088083.1:317-338
GAGCCAGACTGATCCTGCTAAGAATTCTGA317TGCTTGTGGCGGTGTTGGTATTCTCGGTATTGCATGGGCCTTCGGCGGCATG
U_SX-090909_plate73i12.b1 Full-length enriched cDNA library of cassava MECU72 Manihot esculenta cDNA, mRNA sequence.
JG972624.1:311-332
GAGCCAGACTGATCCTGCTAAGAATTCTGA311TGCTTGTGGCGGTGTTGGTATTCTCGGTATTGCATGGGCCTTCGGCGGCATG
U_SX-PL011N01_A_plate37n07.b1 Full-length enriched cDNA library of cassava MECU72 Manihot esculenta cDNA, mRNA sequence.
JG984605.1:309-330
GAGCCAGACTGATCCTGCTAAGAATTCTGA309TGCTTGTGGCGGTGTTGGTATTCTCGGTATTGCATGGGCCTTCCGCGGCATG

Data Export:

下記のフォーマットで最大100000件まで検索結果を取得できます。

Debug Info:

Redirect URI : https://gggenome.dbcls.jp/ja/ddbj/TGCTTGTGGCGGTGTTGGTATT
lang : ja | db : ddbj | k : 0 | strand : | nogap : | query_string : TGCTTGTGGCGGTGTTGGTATT | format : html | download : | debug : 

0.009 | 0.009 | search_start;
0.672 | 0.664 | search_plus_done; http://172.18.8.135:50400/match?q=TGCTTGTGGCGGTGTTGGTATT&k=0&no_gap=0&offset=0&limit=50
0.761 | 0.089 | search_minus_done; http://172.18.8.135:50400/match?q=AATACCAACACCGCCACAAGCA&k=0&no_gap=0&offset=0&limit=39
0.761 | 0.000 | cgi_end;

GGGenome by @meso_cacase at DBCLS
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